44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_5164 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_5164  hypothetical protein  100 
 
 		 285 aa  594  1e-169  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.778802  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4658  hypothetical protein  86.17 
 
 		 289 aa  508  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0239  hypothetical protein  84.42 
 
 		 295 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0077  hypothetical protein  81.52 
 
 		 286 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.490131 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0107  hypothetical protein  81.16 
 
 		 284 aa  483  1e-135  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0247  hypothetical protein  83.09 
 
 		 287 aa  482  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.104382 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0170  hypothetical protein  80.43 
 
 		 284 aa  479  1e-134  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0308  hypothetical protein  80.43 
 
 		 289 aa  479  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0163  hypothetical protein  80.43 
 
 		 284 aa  480  1e-134  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.589028 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3911  hypothetical protein  80.14 
 
 		 289 aa  478  1e-134  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0547466 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4230  hypothetical protein  80.8 
 
 		 290 aa  480  1e-134  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  0.22661 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0073  hypothetical protein  79.35 
 
 		 291 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.247691  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0606  hypothetical protein  79.35 
 
 		 291 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0486  hypothetical protein  80.07 
 
 		 290 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0607779 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3208  hypothetical protein  79.35 
 
 		 288 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0443  hypothetical protein  79.35 
 
 		 288 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00928843  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0424  hypothetical protein  79.35 
 
 		 288 aa  476  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.159981  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1354  hypothetical protein  79.35 
 
 		 288 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105256  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0239  hypothetical protein  79.35 
 
 		 288 aa  476  1e-133  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.644055  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0366  hypothetical protein  79.35 
 
 		 291 aa  477  1e-133  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.191928  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2908  hypothetical protein  76.47 
 
 		 292 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0570741  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6251  hypothetical protein  76.47 
 
 		 292 aa  471  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.471956 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2957  hypothetical protein  76.47 
 
 		 292 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2294  hypothetical protein  76.47 
 
 		 292 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.201529  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0396  hypothetical protein  78.62 
 
 		 291 aa  471  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.289257  normal  0.0165478 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2923  hypothetical protein  76.47 
 
 		 292 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.748941 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2820  hypothetical protein  76.47 
 
 		 292 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.239639  normal  0.287074 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0200  hypothetical protein  78.99 
 
 		 290 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7409  hypothetical protein  78.1 
 
 		 287 aa  464  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.650303 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6152  hypothetical protein  77.98 
 
 		 283 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.484682 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5635  hypothetical protein  78.47 
 
 		 283 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6000  hypothetical protein  78.47 
 
 		 283 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6491  hypothetical protein  78.1 
 
 		 283 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.725464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0451  hypothetical protein  70.59 
 
 		 287 aa  421  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0378  Conserved hypothetical protein. putative conserved domain  67.64 
 
 		 285 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00161389  normal  0.0389324 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0484  hypothetical protein  70.22 
 
 		 287 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0199  hypothetical protein  67.64 
 
 		 285 aa  416  9.999999999999999e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0479  hypothetical protein  70.22 
 
 		 287 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.323829  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3500  hypothetical protein  68.23 
 
 		 282 aa  411  1e-114  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111206  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02215  hypothetical protein  57.66 
 
 		 273 aa  338  7e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.427933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4072  hypothetical protein  26.87 
 
 		 296 aa  79.7  0.00000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.0000279639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3966  hypothetical protein  25.62 
 
 		 262 aa  76.6  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0575992  normal  0.14161 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4173  hypothetical protein  25.37 
 
 		 270 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.883416 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1924  hypothetical protein  24.22 
 
 		 271 aa  71.6  0.00000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.364642  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>