246 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3757 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_3757  diacylglycerol kinase, catalytic region  100 
 
 
325 aa  644    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0973  diacylglycerol kinase catalytic region  60.56 
 
 
360 aa  402  1e-111  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.667474 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5162  diacylglycerol kinase catalytic region  46.15 
 
 
308 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8305  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  43.84 
 
 
319 aa  250  2e-65  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.413626  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3700  diacylglycerol kinase, catalytic region  43.54 
 
 
316 aa  248  1e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4080  diacylglycerol kinase catalytic region  44.14 
 
 
316 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7710  diacylglycerol kinase catalytic region  43.77 
 
 
310 aa  241  1e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.619205 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6288  diacylglycerol kinase catalytic region  43.73 
 
 
325 aa  235  6e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.313771  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4183  diacylglycerol kinase catalytic region  40.56 
 
 
340 aa  232  6e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0557  diacylglycerol kinase, catalytic region  42.64 
 
 
311 aa  232  7.000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2907  diacylglycerol kinase catalytic region  43.45 
 
 
322 aa  226  3e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3694  diacylglycerol kinase catalytic region  40.92 
 
 
310 aa  220  3e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.615831  normal  0.36117 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1418  diacylglycerol kinase, catalytic region  40.73 
 
 
315 aa  219  5e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.765692  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1384  diacylglycerol kinase, catalytic region  41.03 
 
 
315 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.504703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1402  diacylglycerol kinase, catalytic region  41.03 
 
 
315 aa  218  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3693  diacylglycerol kinase catalytic region  44.31 
 
 
307 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4684  diacylglycerol kinase, catalytic region  42.12 
 
 
318 aa  218  2e-55  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.101719  normal  0.196211 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3519  diacylglycerol kinase catalytic region  38.86 
 
 
329 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.62642  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1111  diacylglycerol kinase catalytic region  38.99 
 
 
331 aa  205  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.305762  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30690  sphingosine/diacylglycerol kinase-like enzyme  42.68 
 
 
308 aa  203  2e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.449472  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1783  diacylglycerol kinase, catalytic region  41.34 
 
 
318 aa  203  3e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.900429  normal  0.896009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1413  diacylglycerol kinase catalytic region  45.68 
 
 
305 aa  191  2e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0561  diacylglycerol kinase, catalytic region  37.43 
 
 
342 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.168444  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13244  hypothetical protein  40.18 
 
 
321 aa  167  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.542311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3189  diacylglycerol kinase catalytic region  33.83 
 
 
326 aa  138  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.105458  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2259  diacylglycerol kinase catalytic region  33.43 
 
 
364 aa  92.4  1e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00294376 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0601  diacylglycerol kinase catalytic region  28.18 
 
 
309 aa  88.6  1e-16  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.902429  normal  0.638771 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2518  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.81 
 
 
304 aa  86.3  6e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2187  diacylglycerol kinase catalytic region  30.03 
 
 
305 aa  82.4  0.000000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.670383  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0300  putative lipid kinase  27.53 
 
 
301 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0510  hypothetical protein  27.54 
 
 
303 aa  79.7  0.00000000000006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2760  diacylglycerol kinase catalytic region  26.5 
 
 
304 aa  79.7  0.00000000000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0246521  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0352  putative lipid kinase  27.53 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0308  putative lipid kinase  27.53 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0291  putative lipid kinase  27.53 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0294  putative lipid kinase  27.53 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0396  putative lipid kinase  27.53 
 
 
301 aa  78.6  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0323  putative lipid kinase  27.53 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0355  putative lipid kinase  27.53 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0369  putative lipid kinase  27.53 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4951  putative lipid kinase  27.53 
 
 
301 aa  79  0.0000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0709  diacylglycerol kinase catalytic region  30.42 
 
 
289 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.903799  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1632  diacylglycerol kinase, catalytic region  40.12 
 
 
367 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1448  diacylglycerol kinase catalytic region  35.12 
 
 
325 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0130136  normal  0.551794 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0303  putative lipid kinase  27.22 
 
 
301 aa  75.1  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0721  diacylglycerol kinase catalytic region  29.45 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.42692e-16 
 
 
-
 
NC_002950  PG1348  hypothetical protein  33.94 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0413  sphingosine kinase and DAGKc-like kinase  29.52 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417163  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1675  putative lipid kinase  24.36 
 
 
345 aa  72.8  0.000000000008  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0627  diacylglycerol kinase, catalytic region  32.3 
 
 
315 aa  72.8  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000117369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3700  diacylglycerol kinase catalytic region  27.68 
 
 
304 aa  71.6  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1626  diacylglycerol kinase, catalytic region  27.27 
 
 
290 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000151612  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11690  conserved protein of unknown function BmrU  27.84 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.38542 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0335  putative lipid kinase  25.47 
 
 
308 aa  69.7  0.00000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000000603525  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3229  diacylglycerol kinase catalytic region  28.99 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1578  putative lipid kinase  24.51 
 
 
328 aa  68.6  0.0000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1512  putative lipid kinase  35.17 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0851  putative lipid kinase  32.39 
 
 
339 aa  67.4  0.0000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3998  hypothetical protein  24.26 
 
 
550 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1224  putative lipid kinase  25.95 
 
 
307 aa  67  0.0000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0619  hypothetical protein  30.11 
 
 
300 aa  66.6  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01350  conserved protein of unknown function BmrU  28.24 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.956318  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0393  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.88 
 
 
301 aa  66.2  0.0000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0393706  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_357  hypothetical protein  30.49 
 
 
301 aa  65.9  0.0000000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000445799  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1711  diacylglycerol kinase catalytic region  31.43 
 
 
312 aa  65.9  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0414  hypothetical protein  29.88 
 
 
301 aa  65.1  0.000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0557912  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0561  diacylglycerol kinase, catalytic region  29.26 
 
 
302 aa  65.5  0.000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.323865  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21940  conserved protein of unknown function BmrU  36.49 
 
 
304 aa  64.7  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  0.451971 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4650  hypothetical protein  31.38 
 
 
311 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.303181  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3480  diacylglycerol kinase catalytic region  25.73 
 
 
301 aa  64.3  0.000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2507  lipid kinase  27.81 
 
 
311 aa  63.5  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.594101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0403  diacylglycerol kinase catalytic region  29.29 
 
 
292 aa  63.9  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.749946  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0472  diacylglycerol kinase catalytic region  25.3 
 
 
294 aa  63.5  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4652  diacylglycerol kinase catalytic region  24.84 
 
 
300 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0577  hypothetical protein  28.91 
 
 
323 aa  62.8  0.000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0800  hypothetical protein  41.09 
 
 
292 aa  62.4  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1582  diacylglycerol kinase catalytic region  36.92 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3052  diacylglycerol kinase, catalytic region  34.65 
 
 
274 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.397807  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1439  putative lipid kinase  39.76 
 
 
337 aa  60.5  0.00000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1968  diacylglycerol kinase catalytic region  27.69 
 
 
334 aa  60.8  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4959  bmrU protein  24.18 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4570  diacylglycerol kinase  24.18 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0296  bmrU protein  24.18 
 
 
300 aa  60.5  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2527  hypothetical protein  28.99 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.973765  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1424  diacylglycerol kinase catalytic region  28.45 
 
 
309 aa  60.1  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.945781  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0576  diacylglycerol kinase catalytic region  28.19 
 
 
302 aa  59.7  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1322  diacylglycerol kinase catalytic region  28.45 
 
 
309 aa  59.7  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.772266  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4713  bmrU protein  24.18 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4552  diacylglycerol kinase  24.18 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5075  diacylglycerol kinase family protein  24.18 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1757  diacylglycerol kinase catalytic region  35.2 
 
 
295 aa  59.7  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4938  bmrU protein  24.18 
 
 
300 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0473  putative lipid kinase  36.19 
 
 
342 aa  59.3  0.00000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1510  putative lipid kinase  39.08 
 
 
302 aa  59.3  0.00000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2567  diacylglycerol kinase catalytic region  41.67 
 
 
297 aa  58.5  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.979042  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4976  bmrU protein  24.68 
 
 
300 aa  58.9  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2473  diacylglycerol kinase catalytic region  27.3 
 
 
371 aa  58.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.690635  normal  0.358521 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2372  diacylglycerol kinase catalytic region  34.51 
 
 
307 aa  58.5  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4943  bmrU protein  28 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4093  diacylglycerol kinase catalytic region  23.73 
 
 
296 aa  58.9  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.444037  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>