265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1561 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1561  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  100 
 
 
445 aa  881    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.788962 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6940  Acetyl-CoA hydrolase-like protein  67.35 
 
 
512 aa  511  1e-144  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332624  normal  0.415462 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1241  Acetyl-CoA hydrolase-like protein  60.57 
 
 
429 aa  468  1.0000000000000001e-131  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0827  putative acetyl-CoA hydrolase  58.27 
 
 
412 aa  421  1e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.385566  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1803  acetyl-CoA hydrolase/transferase  53.59 
 
 
402 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0809  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.88 
 
 
428 aa  220  3.9999999999999997e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0965  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.5 
 
 
424 aa  215  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.201698  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1257  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.17 
 
 
453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1027  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.14 
 
 
424 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.719595  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1024  acetyl-CoA hydrolase/transferase  41.14 
 
 
424 aa  213  5.999999999999999e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825013  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2254  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.1 
 
 
428 aa  211  2e-53  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1010  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.38 
 
 
424 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00763151 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1894  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.17 
 
 
428 aa  211  2e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1418  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.74 
 
 
445 aa  210  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.75 
 
 
445 aa  209  8e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2513  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.37 
 
 
430 aa  209  8e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0317951  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0057  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.17 
 
 
420 aa  209  8e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0060  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.66 
 
 
430 aa  208  1e-52  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0404661  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0086  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.34 
 
 
636 aa  207  2e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2497  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.27 
 
 
427 aa  207  3e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.242063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1613  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.28 
 
 
455 aa  203  5e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.925484 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2889  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.73 
 
 
430 aa  202  9e-51  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000123716  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2572  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.18 
 
 
449 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3493  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.22 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.786006 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2747  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.18 
 
 
428 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2639  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.18 
 
 
449 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2898  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  40.23 
 
 
428 aa  199  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.669885  normal  0.828985 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2830  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.88 
 
 
428 aa  199  7e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.672634  normal  0.961785 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1748  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.66 
 
 
611 aa  199  7e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1423  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.01 
 
 
428 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2715  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.68 
 
 
429 aa  199  1.0000000000000001e-49  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.268701  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1708  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  39.58 
 
 
428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2399  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.34 
 
 
428 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.813722 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2104  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  37.66 
 
 
432 aa  198  2.0000000000000003e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1526  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.58 
 
 
428 aa  197  3e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0862  acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.69 
 
 
428 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1517  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.58 
 
 
428 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1552  acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.58 
 
 
428 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00185  fused 4-Hydroxybutyrate CoA-transferase/acetyltransferase domain of GNAT  38.74 
 
 
615 aa  196  7e-49  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0911  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.47 
 
 
431 aa  196  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0405623 
 
 
-
 
NC_002950  PG0690  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  35.74 
 
 
431 aa  195  1e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000582871 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2743  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.53 
 
 
432 aa  194  3e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3070  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.86 
 
 
645 aa  194  3e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155657 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4998  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.84 
 
 
432 aa  192  1e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.410029  normal  0.0205642 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0532  acetyl-CoA hydrolase  35.98 
 
 
432 aa  191  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.000000818274  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0950  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.01 
 
 
443 aa  191  2.9999999999999997e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.540968  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3773  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40.35 
 
 
431 aa  190  4e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.232234  normal  0.702768 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.18 
 
 
623 aa  190  5e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000807125  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1956  4-hydroxybutyrate CoA-transferase  34.58 
 
 
431 aa  189  8e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1278  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.19 
 
 
634 aa  189  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.863753  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0619  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.34 
 
 
627 aa  187  3e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19050  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.5 
 
 
428 aa  187  4e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1793  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.13 
 
 
614 aa  187  4e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00194756  normal  0.574819 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1656  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase, putative/acetyltransferase, GNAT family protein  38.25 
 
 
622 aa  186  7e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2142  GCN5-related N-acetyltransferase:Acetyl-CoA hydrolase/transferase  39.34 
 
 
617 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2824  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40 
 
 
616 aa  183  4.0000000000000006e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1430  acetyl-CoA hydrolase/transferase  40 
 
 
616 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0209565  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0283  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.63 
 
 
431 aa  180  5.999999999999999e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.230364  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0610  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  33.76 
 
 
445 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.684437  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1651  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  33.76 
 
 
443 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1934  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  33.76 
 
 
443 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.861274  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3745  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.87 
 
 
432 aa  179  7e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1727  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  33.76 
 
 
443 aa  179  7e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7279  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  38.94 
 
 
430 aa  179  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2054  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.73 
 
 
441 aa  178  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0198226  hitchhiker  0.00000220967 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0603  acetyl-CoA hydrolase/transferase  36.56 
 
 
434 aa  178  1e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2303  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  33.5 
 
 
443 aa  178  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0701  acetyl-CoA hydrolase/transferase family protein  33.5 
 
 
443 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2220  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  33.5 
 
 
443 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.204063  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3573  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.73 
 
 
437 aa  177  5e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0018283  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2815  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.22 
 
 
437 aa  176  7e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1439  acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.22 
 
 
437 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3294  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.83 
 
 
437 aa  173  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1976  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.11 
 
 
633 aa  172  9e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0141  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.43 
 
 
426 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1561  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.33 
 
 
437 aa  170  5e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.211696  normal  0.891622 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0123  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.13 
 
 
441 aa  169  8e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.281675 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3304  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.82 
 
 
437 aa  168  1e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0516  acetyl-CoA hydrolase  29.95 
 
 
438 aa  167  4e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3916  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.24 
 
 
442 aa  167  5e-40  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0193  acetyl-CoA hydrolase/transferase  37.82 
 
 
433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0716  acetyl-CoA hydrolase/transferase  32.17 
 
 
431 aa  164  3e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.413147  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2513  Acetyl-CoA hydrolase/transferase  35.01 
 
 
479 aa  162  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.293935  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0053  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.33 
 
 
431 aa  161  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.123416 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1735  acetyl-CoA hydrolase  32.55 
 
 
431 aa  161  2e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000187656  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0746  acetyl-CoA hydrolase/transferase  34.41 
 
 
634 aa  161  2e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3253  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.06 
 
 
407 aa  160  4e-38  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.301436  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2158  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  33.43 
 
 
440 aa  159  1e-37  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2116  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  33.43 
 
 
440 aa  158  2e-37  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.449601 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0382  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.97 
 
 
448 aa  157  3e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2268  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.14 
 
 
440 aa  156  8e-37  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1785  acetyl-CoA hydrolase/transferase  27.69 
 
 
446 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3293  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  32.56 
 
 
441 aa  147  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.326254 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6899  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.53 
 
 
423 aa  147  5e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1315  acetyl-CoA hydrolase/transferase  33.01 
 
 
441 aa  146  6e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.593441  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2447  putative acetyl-CoA hydrolase  31.9 
 
 
445 aa  144  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3360  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  32.27 
 
 
441 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3367  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  32.27 
 
 
441 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.729069 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3462  4-hydroxybutyrate coenzyme A transferase  32.27 
 
 
441 aa  144  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.366103  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2858  acetyl-CoA hydrolase/transferase  31.11 
 
 
446 aa  143  6e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>