24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_1127 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007777  Francci3_1127  lantibiotic dehydratase-like  100 
 
 
1029 aa  1979    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3315  lantibiotic dehydratase-like  38.78 
 
 
1027 aa  536  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.301651 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1821  lantibiotic dehydratase-like  41.6 
 
 
1074 aa  505  1e-141  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.525811  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2799  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  36.84 
 
 
1021 aa  496  1e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1332  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  39.37 
 
 
1066 aa  487  1e-136  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.591859  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2033  lantibiotic dehydratase-like  40.94 
 
 
1031 aa  475  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.423471  normal  0.294126 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0602  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  38.97 
 
 
1009 aa  445  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0056  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  37.84 
 
 
1035 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6755  lantibiotic dehydratase domain-containing protein  38.25 
 
 
915 aa  423  1e-117  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4647  Lantibiotic dehydratase domain protein  36.43 
 
 
1042 aa  403  1e-111  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3936  Lantibiotic dehydratase domain protein  37.11 
 
 
729 aa  350  8e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.139143  normal  0.0810168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5417  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  30.67 
 
 
968 aa  213  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.944486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3602  Lantibiotic dehydratase domain-containing protein  30.38 
 
 
964 aa  207  8e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.22565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3530  hypothetical protein  38.31 
 
 
373 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.212487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1436  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.39 
 
 
1038 aa  163  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0903  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.62 
 
 
1036 aa  158  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3392  Lantibiotic dehydratase domain protein  24.61 
 
 
1042 aa  142  3.9999999999999997e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262468  normal  0.618003 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2131  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.29 
 
 
1013 aa  136  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0879912  normal  0.662037 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4704  Lantibiotic dehydratase domain protein  23.58 
 
 
1060 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4694  Lantibiotic dehydratase domain protein  29.07 
 
 
987 aa  116  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.908748  normal  0.810572 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0556  Lantibiotic dehydratase domain protein  20.99 
 
 
757 aa  99.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.111003 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0066  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.26 
 
 
1148 aa  94.7  8e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.433774 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4714  Lantibiotic dehydratase domain protein  26.73 
 
 
1055 aa  89  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4205  Lantibiotic dehydratase domain protein  28.76 
 
 
937 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.254357  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>