31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0237 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0237  tyrosinase  100 
 
 		 343 aa  691    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.636465 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0747  tyrosinase  37.38 
 
 		 300 aa  159  8e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0871441  decreased coverage  0.0000143544 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2156  tyrosinase/peptidase  32.72 
 
 		 495 aa  129  8.000000000000001e-29  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1947  tyrosinase  32.47 
 
 		 279 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.369199  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3575  Monophenol monooxygenase  31.76 
 
 		 971 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3461  tyrosinase  31.6 
 
 		 281 aa  106  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.122565 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0256  tyrosinase  32.96 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000141687 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0211  tyrosinase  32.96 
 
 		 247 aa  100  3e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.965702  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1501  tyrosinase oxidoreductase protein  30.25 
 
 		 412 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.951437  normal  0.940598 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6429  monophenol monooxygenase  29.51 
 
 		 536 aa  74.7  0.000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6129  monophenol monooxygenase  29.51 
 
 		 536 aa  74.3  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.174842  normal  0.452911 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2941  tyrosinase  27.75 
 
 		 515 aa  67.4  0.0000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.304449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5336  tyrosinase  29.54 
 
 		 548 aa  65.5  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.113855 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10821  conserved hypothetical protein  24.57 
 
 		 369 aa  59.3  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.233309  normal  0.135449 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1610  tyrosinase  27.31 
 
 		 493 aa  58.5  0.0000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.750948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0337  polyphenol oxidase B precursor  25.37 
 
 		 496 aa  57  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05311  tyrosinase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G01070)  24.79 
 
 		 383 aa  56.6  0.0000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.00354279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0968  tyrosinase  43.1 
 
 		 514 aa  56.2  0.0000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.530534  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0920  tyrosinase  34.34 
 
 		 566 aa  55.8  0.000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4746  tyrosinase  41.94 
 
 		 503 aa  55.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131877  normal  0.385024 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1914  tyrosinase  27.14 
 
 		 874 aa  54.7  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.73895  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01318  conserved hypothetical protein  25.48 
 
 		 378 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.569487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6986  putative tyrosinase  25.45 
 
 		 542 aa  50.8  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.348811  normal  0.542589 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0527  tyrosinase  33.33 
 
 		 345 aa  50.1  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4643  tyrosinase  25.32 
 
 		 599 aa  47.4  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.515379  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1836  tyrosinase  23.01 
 
 		 534 aa  47  0.0005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09388  conserved hypothetical protein  25.6 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0799455 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08435  hypothetical protein  40.48 
 
 		 850 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2490  putative tyrosinase  34.85 
 
 		 535 aa  44.3  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0652577  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1018  tyrosinase  24.28 
 
 		 666 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2167  tyrosinase  27.54 
 
 		 416 aa  43.9  0.004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.649942  normal  0.0551649 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>