52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_1410 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010644  Emin_1410  ribosomal protein L29  100 
 
 		 67 aa  129  2.0000000000000002e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  43.64 
 
 		 67 aa  52.8  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0303  ribosomal protein L29  43.64 
 
 		 62 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00299137  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  43.28 
 
 		 69 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  37.04 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  37.04 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  37.04 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 68 aa  43.9  0.0008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0434  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 		 64 aa  43.1  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000157908  hitchhiker  0.0000885685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1623  ribosomal protein L29  41.07 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  33.33 
 
 		 68 aa  43.5  0.001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 88 aa  43.5  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 67 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  36.84 
 
 		 83 aa  42.7  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  32.84 
 
 		 70 aa  42.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  36.21 
 
 		 71 aa  42.7  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  35 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  35 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  35 
 
 		 71 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4351  ribosomal protein L29  38.1 
 
 		 64 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000000139605  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 69 aa  41.6  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0775  50S ribosomal protein L29  39.68 
 
 		 69 aa  42  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.537703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 61 aa  41.2  0.004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  41.6  0.004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  41.2  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 		 64 aa  41.2  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0492  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000269132  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0497  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000000428226  hitchhiker  0.00371389 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  34.55 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3516  ribosomal protein L29  40.91 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000165704  hitchhiker  0.00000095159 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 63 aa  40.8  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  35.59 
 
 		 67 aa  40.8  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 62 aa  40.4  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  39.66 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  39.29 
 
 		 85 aa  40.4  0.008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  38.33 
 
 		 63 aa  40.4  0.008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  29.85 
 
 		 68 aa  40.4  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  34.43 
 
 		 67 aa  40  0.01  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>