20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0936 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0936  peptidase M15A  100 
 
 
151 aa  315  1e-85  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000598155  hitchhiker  0.00000362871 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1075  peptidase M15A  43.09 
 
 
157 aa  95.5  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2481  peptidase M15A  33.33 
 
 
146 aa  70.9  0.000000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.307729  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1627  peptidase M15A  32.23 
 
 
143 aa  67  0.00000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.696702  normal  0.174828 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2260  peptidase M15A  29.37 
 
 
162 aa  67  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4060  peptidase M15A  33.33 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000018588 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1066  hypothetical protein  33.87 
 
 
149 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3631  peptidase M15A  33.06 
 
 
143 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.935739  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2108  peptidase M15A  31.2 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0272473 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1650  peptidase M15A  29.03 
 
 
143 aa  57  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.309643  normal  0.633092 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1851  peptidase M15A  35.44 
 
 
224 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0969935  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3367  hypothetical protein  36.25 
 
 
165 aa  49.3  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2171  peptidase M15A  33.59 
 
 
184 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0551853 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1672  peptidase M15A  36.56 
 
 
146 aa  46.2  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.261869  normal  0.0407517 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6567  Peptidase M15A  31.37 
 
 
513 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0241  hypothetical protein  31.75 
 
 
129 aa  43.9  0.0007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.676098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01180  hypothetical protein  30.17 
 
 
355 aa  43.5  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.137096  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1926  peptidase M15A  33.96 
 
 
459 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1548  Peptidase M15A  38.1 
 
 
347 aa  41.2  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0248  Peptidase M15A  43.18 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>