225 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcolC_4276 on replicon NC_010468
Organism: Escherichia coli ATCC 8739



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03602  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4249  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03546  hypothetical protein  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4276  putative 6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3932  putative 6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.548277  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4227  putative 6-phosphogluconolactonase  100 
 
 
240 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0969  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  55.23 
 
 
238 aa  278  5e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl031  putative 6-phosphogluconolactonase  37.55 
 
 
239 aa  193  2e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2160  putative 6-phosphogluconolactonase  42.86 
 
 
237 aa  190  2e-47  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2431  glucosamine-6-phosphate deaminase  31.1 
 
 
242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2744  glucosamine-6-phosphate deaminase  30.71 
 
 
242 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2155  glucosamine-6-phosphate isomerase  32.68 
 
 
242 aa  114  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.998917 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06760  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.59 
 
 
249 aa  113  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.000000583825  normal  0.599232 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1433  glucosamine-6-phosphate deaminase  32.52 
 
 
253 aa  109  4.0000000000000004e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.111516  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1200  Glucosamine-6-phosphate deaminase  32.66 
 
 
242 aa  108  6e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0236  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.22 
 
 
250 aa  108  1e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0167  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.06 
 
 
244 aa  102  5e-21  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0765559  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1008  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.72 
 
 
268 aa  102  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0823298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22920  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.72 
 
 
241 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1660  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  31.12 
 
 
637 aa  97.8  1e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3582  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.2 
 
 
236 aa  98.2  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000420118  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0749  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.34 
 
 
242 aa  97.4  2e-19  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0150  glucosamine-6-phosphate deaminase  32.68 
 
 
268 aa  97.4  2e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2077  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.28 
 
 
256 aa  96.7  3e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0644  glucosamine-6-phosphate isomerase  41.98 
 
 
236 aa  95.9  5e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1219  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.16 
 
 
256 aa  94  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0581  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.02 
 
 
233 aa  94  2e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000075692  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0225  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  28.05 
 
 
243 aa  93.6  2e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.535375  normal  0.600106 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0338  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.69 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0368594  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2997  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.69 
 
 
266 aa  93.2  3e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2815  Glucosamine-6-phosphate deaminase  30.89 
 
 
242 aa  92.4  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3702  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.6 
 
 
247 aa  92  8e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.355712  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2131  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  28.63 
 
 
240 aa  91.7  9e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2772  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.55 
 
 
246 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2909  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.29 
 
 
266 aa  91.3  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.614639  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.4 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1521  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.29 
 
 
279 aa  90.9  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1961  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.69 
 
 
260 aa  90.5  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.297856 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2749  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.7 
 
 
261 aa  89.7  3e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0354  glucosamine-6-phosphate isomerase  30.7 
 
 
233 aa  89.4  4e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00072402  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2381  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  27.53 
 
 
642 aa  89.4  5e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136647  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2216  glucosamine-6-phosphate isomerase  29.2 
 
 
251 aa  89  6e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1861  glucosamine-6-phosphate isomerase  28.79 
 
 
247 aa  89  7e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000152113  hitchhiker  0.000000000130899 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1227  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.89 
 
 
266 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.207086  normal  0.0742829 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4812  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  27.49 
 
 
642 aa  88.2  1e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.116561  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0799  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.76 
 
 
233 aa  86.7  3e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.201106  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3582  galactosamine-6-phosphate isomerase  27.04 
 
 
236 aa  86.7  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.66727  normal  0.197567 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4557  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  28.12 
 
 
670 aa  86.3  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.296514  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0405  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.92 
 
 
253 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0337  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.57 
 
 
270 aa  85.5  7e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00000149372  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1049  glucosamine-6-phosphate isomerase  34.33 
 
 
260 aa  85.1  9e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2812  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.98 
 
 
266 aa  84.3  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1615  Glucosamine-6-phosphate deaminase  27.6 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0815  glucosamine-6-phosphate isomerase  26 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.288891  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000962  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.63 
 
 
266 aa  84  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000448819  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2791  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.85 
 
 
642 aa  84  0.000000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1656  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.53 
 
 
240 aa  83.6  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0631  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.53 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.676761  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6570  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  28.03 
 
 
641 aa  83.2  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220945  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1652  glucosamine-6-phosphate isomerase  26.91 
 
 
266 aa  83.6  0.000000000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0766585  normal  0.955714 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2322  glucosamine-6-phosphate deaminase  37.4 
 
 
259 aa  82.8  0.000000000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000116436 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3128  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.09 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0715238  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1193  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.49 
 
 
266 aa  82.4  0.000000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.455857  decreased coverage  0.0000186217 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0209  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.59 
 
 
270 aa  82  0.000000000000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.147948  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1822  glucosamine-6-phosphate isomerase  31.36 
 
 
303 aa  82  0.000000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000307533  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00670  glucosamine-6-phosphate isomerase  33.58 
 
 
260 aa  81.6  0.00000000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.898664  normal  0.115582 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01050  Glucosamine-6-phosphate isomerase, putative  28.37 
 
 
339 aa  81.6  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0844  glucosamine-6-phosphate isomerase  24.4 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1508  glucosamine-6-phosphate isomerase  27.75 
 
 
252 aa  81.6  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0216  glucosamine-6-phosphate deaminase  25.9 
 
 
266 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0760  glucosamine-6-phosphate isomerase  24.8 
 
 
263 aa  80.9  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1667  glucosamine-6-phosphate isomerase  26.32 
 
 
235 aa  80.9  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00815686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2590  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.21 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.161657  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0743  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.09 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.248454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0839  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.09 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0731  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.09 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.611373  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0790  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.09 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0803  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.09 
 
 
266 aa  79.7  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1026  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  28.69 
 
 
234 aa  79.3  0.00000000000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000150801  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0960  glucosamine-6-phosphate deaminase  24.39 
 
 
261 aa  79  0.00000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.160778  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0180  glucosamine/galactosamine-6-phosphate isomerase  36.72 
 
 
262 aa  79  0.00000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5415  glucosamine-6-phosphate isomerase  26 
 
 
657 aa  78.6  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.700694  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1114  glucosamine-6-phosphate deaminase  25.9 
 
 
266 aa  78.6  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.646109  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2135  glucosamine-6-phosphate isomerase  26.98 
 
 
276 aa  78.6  0.00000000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000621697  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3813  glucosamine-6-phosphate deaminase-like protein  28.64 
 
 
646 aa  78.6  0.00000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.551853 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1348  glucosamine-6-phosphate isomerase  26.96 
 
 
261 aa  77.8  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000459802 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1203  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.69 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.25247  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0490  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.69 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.532501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2753  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.91 
 
 
262 aa  77.8  0.0000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1075  glucosamine-6-phosphate deaminase  28.57 
 
 
262 aa  77  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.115447  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0943  glucosamine-6-phosphate isomerase  26 
 
 
264 aa  77  0.0000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0718256  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0237  glucosamine-6-phosphate isomerase  25.1 
 
 
260 aa  76.6  0.0000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0564  Glucosamine-6-phosphate deaminase  26.38 
 
 
233 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4163  glucosamine-6-phosphate deaminase  27.27 
 
 
262 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000395689  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3623  galactosamine-6-phosphate isomerase  26.38 
 
 
251 aa  76.3  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0557  galactosamine-6-phosphate isomerase  26.38 
 
 
233 aa  75.9  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.852115  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03008  galactosamine-6-phosphate isomerase  26.38 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02959  hypothetical protein  26.38 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07002  glucosamine-6-phosphate deaminase  26.95 
 
 
266 aa  75.9  0.0000000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0698  glucosamine-6-phosphate deaminase  25.9 
 
 
266 aa  75.5  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0261175  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>