22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1671 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1671  protein FimH-like protein  100 
 
 		 304 aa  616  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.817928 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2115  protein FimH homolog  98.36 
 
 		 304 aa  608  1e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.173626 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2144  FimH mannose-binding domain protein  97.37 
 
 		 304 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.075619  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01460  predicted fimbrial-like adhesin protein  97.37 
 
 		 304 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01472  hypothetical protein  97.37 
 
 		 304 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1586  protein FimH-like protein  97.37 
 
 		 304 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1691  protein FimH-like protein  98.03 
 
 		 304 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2155  FimH mannose-binding domain-containing protein  97.37 
 
 		 304 aa  604  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3677  FimH mannose-binding domain protein  47.47 
 
 		 300 aa  262  6.999999999999999e-69  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.376605  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4847  protein FimH  47.14 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.691376 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5826  protein FimH  47.14 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4546  protein FimH  47.14 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4917  protein FimH  46.53 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3743  FimH mannose-binding domain-containing protein  47.14 
 
 		 300 aa  260  2e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0870674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4794  protein FimH  47.14 
 
 		 300 aa  260  3e-68  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04189  minor component of type 1 fimbriae  47.14 
 
 		 300 aa  259  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04151  hypothetical protein  46.8 
 
 		 300 aa  256  4e-67  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1764  protein FimH  96.61 
 
 		 59 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3389  fimbrial protein  25.31 
 
 		 317 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.261644 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1816  fimbrial protein-like protein  28.66 
 
 		 338 aa  53.1  0.000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0146115 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0083  fimbrial protein  26.16 
 
 		 321 aa  51.2  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2875  fimbrial protein  27.36 
 
 		 355 aa  50.8  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>