28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcHS_A0941 on replicon NC_009800
Organism: Escherichia coli HS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  100 
 
 		 137 aa  279  8.000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  72.97 
 
 		 200 aa  110  8.000000000000001e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  72.97 
 
 		 197 aa  109  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  71.62 
 
 		 200 aa  108  3e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  71.62 
 
 		 200 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  71.62 
 
 		 200 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  70.27 
 
 		 200 aa  106  8.000000000000001e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  68.92 
 
 		 114 aa  103  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  44.2 
 
 		 131 aa  99.8  1e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  46.91 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  37.17 
 
 		 146 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2490  tail assembly chaperone gp38  44 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0688487  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  38.75 
 
 		 147 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.728872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  37.84 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  37.84 
 
 		 145 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  34.26 
 
 		 147 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  41.1 
 
 		 198 aa  51.2  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2760  tail assembly chaperone gp38  36 
 
 		 139 aa  49.7  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000085866 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  33.68 
 
 		 138 aa  47  0.00008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2471  tail fiber assembly protein  35 
 
 		 121 aa  46.6  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134956 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1644  tail fiber assembly protein  39.13 
 
 		 193 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0872  putative Tail fiber assembly protein homolog  31.07 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  36.76 
 
 		 145 aa  42.4  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3068  tail assembly chaperone gp38  37.68 
 
 		 247 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.577916  n/a   
 
 
-
 
NC_009829  Spro_4954  tail assembly chaperone gp38  33.63 
 
 		 170 aa  42  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.516672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2784  tail fiber assembly protein  35.21 
 
 		 194 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000096055  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  33.82 
 
 		 145 aa  40  0.01  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  29.9 
 
 		 139 aa  40  0.01  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>