56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2614 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A1147  hypothetical protein  100 
 
 
119 aa  251  3e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00813914  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2614  (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase-like protein  100 
 
 
119 aa  251  3e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00662399  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1148  hypothetical protein  100 
 
 
121 aa  249  1e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1296  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  95.76 
 
 
314 aa  240  6e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.275546 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2568  hypothetical protein  100 
 
 
107 aa  226  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.078573 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2546  acyl transferase domain-containing protein  31.13 
 
 
315 aa  65.1  0.0000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.425982  normal  0.398062 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0128  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.2 
 
 
293 aa  51.6  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.199952  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0130  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.2 
 
 
293 aa  51.6  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1034  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.34 
 
 
291 aa  50.1  0.00001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.24557  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3360  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.25 
 
 
313 aa  47.8  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2183  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.1 
 
 
315 aa  47.4  0.00006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.944962  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1525  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.67 
 
 
319 aa  47  0.00009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0665  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  34.92 
 
 
306 aa  45.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0426471  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0601  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase, putative  30.43 
 
 
325 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1690  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  33.33 
 
 
317 aa  45.4  0.0003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0491  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.1 
 
 
310 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0869  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.89 
 
 
326 aa  45.1  0.0003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0556  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  35.48 
 
 
310 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0176  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.82 
 
 
304 aa  44.3  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0138  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  31.58 
 
 
293 aa  44.3  0.0006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.488001 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0527  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  37.1 
 
 
310 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.13441 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3021  Erythronolide synthase  33.33 
 
 
1087 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3100  Acyl transferase  33.33 
 
 
866 aa  43.9  0.0008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.304625  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2587  PfaD family protein  28.99 
 
 
865 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2852  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.03 
 
 
310 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0331918  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1801  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.03 
 
 
310 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.620904  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0531  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  29.03 
 
 
310 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3093  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  27.5 
 
 
410 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2803  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.03 
 
 
310 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.447298  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2478  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.03 
 
 
310 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7299  polyketide synthetase  28.04 
 
 
1466 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2906  acyl-carrier-protein S-malonyltransferase  29.03 
 
 
310 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.360447  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2791  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.03 
 
 
310 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.562737  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0960  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.68 
 
 
309 aa  42.4  0.002  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.896286  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1050  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  26.5 
 
 
311 aa  42.4  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0651965  normal  0.0987344 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1769  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  34.72 
 
 
313 aa  42  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.199866  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0611  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  26.88 
 
 
299 aa  42  0.003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000665754  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0642  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.03 
 
 
310 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1080  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.03 
 
 
310 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.720629 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0998  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.03 
 
 
310 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1122  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.03 
 
 
310 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5012  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.77 
 
 
291 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2597  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  34.33 
 
 
2284 aa  41.2  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2561  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  32.61 
 
 
304 aa  41.2  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1002  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.03 
 
 
310 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1577  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  33.87 
 
 
309 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.74121e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0132  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  26.67 
 
 
301 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.446703  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4234  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  29.03 
 
 
310 aa  41.2  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3966  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.88 
 
 
292 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.147046  normal  0.712508 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1718  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  29.03 
 
 
309 aa  40.8  0.007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1730  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.89 
 
 
290 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.21848  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6954  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  30.88 
 
 
297 aa  40.4  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.880714  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1836  (acyl-carrier-protein) S-malonyltransferase  34.43 
 
 
311 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0932206  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1221  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  28.57 
 
 
310 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0662876 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3200  malonyl CoA-acyl carrier protein transacylase  25.51 
 
 
311 aa  40  0.01  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1073  [Acyl-carrier-protein] S-malonyltransferase  29.23 
 
 
311 aa  40  0.01  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>