30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_1304 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_1304  tail assembly chaperone gp38  100 
 
 		 146 aa  299  1e-80  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.230331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3033  tail fiber assembly protein  69.44 
 
 		 147 aa  207  4e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000648798 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0299  tail fiber assembly protein  68.06 
 
 		 147 aa  204  3e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.728872 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00846  conserved hypothetical protein  67.36 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00852  hypothetical protein  67.36 
 
 		 145 aa  198  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2760  tail assembly chaperone gp38  67.23 
 
 		 139 aa  158  3e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000085866 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0820  phage tail assembly chaperone gp38  55.32 
 
 		 142 aa  153  8e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2490  tail assembly chaperone gp38  63.27 
 
 		 210 aa  128  3e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0688487  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2471  tail fiber assembly protein  52.21 
 
 		 121 aa  119  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00134956 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1052  phage tail assembly chaperone gp38  34.93 
 
 		 140 aa  88.6  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0915  tail assembly chaperone gp38  35 
 
 		 142 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3110  tail assembly chaperone gp38  35.33 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.130843  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0182  hypothetical protein  34.67 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0941  putative tail fiber assembly protein  37.17 
 
 		 137 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0692  hypothetical protein  35.79 
 
 		 194 aa  58.9  0.00000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2346  hypothetical protein  34.78 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2808  tail assembly chaperone gp38  30.28 
 
 		 139 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4023  tail assembly chaperone gp38  32.47 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2759  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000908962 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3034  Tail fiber assembly protein homolog  37.5 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000774391 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1305  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 114 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.059045  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2491  tail assembly chaperone gp38  37.5 
 
 		 200 aa  47.4  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0363657  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0300  Tail fiber assembly protein homolog  37.5 
 
 		 197 aa  47.4  0.00007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.656983 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00853  hypothetical protein  36.11 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00847  e14 prophage; predicted tail fiber assembly protein  36.11 
 
 		 200 aa  46.6  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3091  tail assembly chaperone gp38  34.38 
 
 		 138 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2371  putative phage tail fiber assembly protein  33.68 
 
 		 139 aa  45.4  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.786543  normal  0.362441 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3483  phage tail assembly chaperone gp38  33.85 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.153729  normal  0.0386955 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1479  tail fiber assembly protein  38.57 
 
 		 194 aa  41.2  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1285  tail fiber assembly protein  38.57 
 
 		 194 aa  41.2  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>