25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_0080 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0080  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  100 
 
 		 232 aa  468  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3915  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  70.26 
 
 		 232 aa  342  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.852659  hitchhiker  0.00982926 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4103  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  69.83 
 
 		 232 aa  341  5.999999999999999e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0268948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3934  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  69.83 
 
 		 232 aa  340  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4041  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  69.83 
 
 		 232 aa  340  9e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.763682  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3996  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  69.4 
 
 		 232 aa  339  2e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.829287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03433  hypothetical protein  52.17 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0084  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  52.17 
 
 		 230 aa  258  5.0000000000000005e-68  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.587273  normal  0.0144174 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3962  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  52.17 
 
 		 230 aa  258  8e-68  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0815818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4128  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  52.17 
 
 		 230 aa  257  1e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.150359  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3836  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  51.74 
 
 		 230 aa  256  2e-67  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000107389  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4052  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  50.87 
 
 		 230 aa  249  2e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03482  WaaY protein, involved in phospohrylation of core oligosaccharide heptose  56.35 
 
 		 182 aa  224  6e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4998  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  60 
 
 		 168 aa  187  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0418817  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19231  hypothetical protein  27.5 
 
 		 618 aa  42.7  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.494256  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1143  protein of unknown function RIO1  21.89 
 
 		 265 aa  42.7  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2240  ABC-1 domain protein  26.58 
 
 		 557 aa  42.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.319336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1172  2-polyprenylphenol 6-hydroxylase  30.38 
 
 		 558 aa  42.4  0.006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2106  hypothetical protein  30.38 
 
 		 559 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766182 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2150  ABC-1 domain protein  26.58 
 
 		 557 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.181383  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1699  2-octaprenylphenol hydroxylase  26.58 
 
 		 557 aa  42.4  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4898  ABC1 family protein  36.23 
 
 		 558 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_86278  predicted protein  26.62 
 
 		 620 aa  42  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2512  hypothetical protein  25.56 
 
 		 569 aa  42  0.007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.857337 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2458  ABC-1 domain protein  28.57 
 
 		 551 aa  41.6  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>