19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_1143 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1143  protein of unknown function RIO1  100 
 
 		 265 aa  522  1e-147  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.358332  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3109  protein of unknown function RIO1  62.5 
 
 		 275 aa  335  5e-91  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2329  Mn2+dependent serine/threonine protein kinase  61.36 
 
 		 269 aa  325  4.0000000000000003e-88  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.107265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1148  aminoglycoside phosphotransferase  60.23 
 
 		 269 aa  316  2e-85  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0586  protein of unknown function RIO1  56.6 
 
 		 265 aa  314  9.999999999999999e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.261932  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1280  RIO-like kinase  27.91 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0701  Non-specific serine/threonine protein kinase  30.56 
 
 		 306 aa  50.4  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.577267  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5014  serine/threonine protein kinase  36.28 
 
 		 287 aa  50.4  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06339  PAK-related kinase (Eurofung)  36 
 
 		 934 aa  49.3  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1605  Non-specific serine/threonine protein kinase  35.11 
 
 		 338 aa  48.9  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1977  protein of unknown function RIO1  36.45 
 
 		 306 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2423  serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 		 718 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3687  serine/threonine protein kinase  30.49 
 
 		 416 aa  45.8  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.517682 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2660  protein of unknown function RIO1  32.26 
 
 		 334 aa  45.4  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.365628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  31.52 
 
 		 795 aa  44.3  0.002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2847  serine/threonine protein kinase  35.42 
 
 		 416 aa  43.5  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.701081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2087  RIO-like kinase  26.85 
 
 		 291 aa  42.7  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0080  lipopolysaccharide core biosynthesis protein  21.89 
 
 		 232 aa  42.7  0.006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2984  Serine/threonine protein kinase involved in cell cycle control-like protein  27.96 
 
 		 291 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.513296  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>