26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECH74115_3477 on replicon NC_011353
Organism: Escherichia coli O157:H7 str. EC4115



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011353  ECH74115_3477  fimbrial protein  100 
 
 
88 aa  177  4e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.870738  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  87.5 
 
 
163 aa  152  2e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  57.47 
 
 
168 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  57.47 
 
 
161 aa  102  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  51.72 
 
 
169 aa  94  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  51.72 
 
 
169 aa  94  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  51.72 
 
 
169 aa  94  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  48.28 
 
 
170 aa  88.2  4e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  45.45 
 
 
170 aa  83.6  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  44.32 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  44.32 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  43.68 
 
 
167 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  44.32 
 
 
170 aa  78.2  0.00000000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  45.45 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0174095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  45.45 
 
 
168 aa  75.5  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  45.45 
 
 
168 aa  76.3  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  44.32 
 
 
168 aa  74.3  0.0000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  40.28 
 
 
158 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  41.67 
 
 
149 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  38.37 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  37.21 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  37.21 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  37.21 
 
 
162 aa  41.6  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  36.76 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  38.24 
 
 
158 aa  41.2  0.005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  38.24 
 
 
158 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>