More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0178 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0178  membrane protein  100 
 
 		 327 aa  656    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.945445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1944  membrane protein  77.59 
 
 		 242 aa  360  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0172  membrane protein  75.63 
 
 		 200 aa  311  9e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0104  membrane protein  61.66 
 
 		 223 aa  248  8e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2284  protein of unknown function DUF205  59.18 
 
 		 196 aa  206  4e-52  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3022  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  51.55 
 
 		 194 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3922  membrane protein  46.6 
 
 		 195 aa  139  4.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0926824  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0587  membrane protein  45.69 
 
 		 193 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00102729 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0574  membrane protein  45.18 
 
 		 193 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000985335  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2305  hypothetical protein  34.38 
 
 		 277 aa  132  6.999999999999999e-30  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3020  membrane protein  47.49 
 
 		 194 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0507  membrane protein  44.16 
 
 		 194 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2278  hypothetical protein  34.38 
 
 		 277 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2952  membrane protein  42.27 
 
 		 194 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.71102  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0425  protein of unknown function DUF205  37.75 
 
 		 195 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000493377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0651  membrane protein  41.15 
 
 		 196 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.623909  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2642  membrane protein  44.62 
 
 		 198 aa  124  3e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0575  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.77 
 
 		 200 aa  119  7e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2834  hypothetical protein  40.4 
 
 		 214 aa  119  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4194  membrane protein  43.5 
 
 		 201 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1700  protein of unknown function DUF205  40.43 
 
 		 204 aa  115  1.0000000000000001e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.202165  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4326  membrane protein  44 
 
 		 201 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1324  hypothetical protein  39.06 
 
 		 195 aa  115  1.0000000000000001e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4343  membrane protein  42.35 
 
 		 203 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.213593  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4349  membrane protein  44 
 
 		 201 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1078  hypothetical protein  41.33 
 
 		 216 aa  113  5e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.243198  normal  0.820114 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2138  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.49 
 
 		 215 aa  113  5e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.684068  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1629  protein of unknown function DUF205  34.52 
 
 		 203 aa  112  8.000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.507494  hitchhiker  0.001161 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1999  protein of unknown function DUF205  36.63 
 
 		 207 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000645882  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3015  protein of unknown function DUF205  39.59 
 
 		 203 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.400755  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1347  membrane protein  40.41 
 
 		 196 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0882289  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1339  membrane protein  44.09 
 
 		 196 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0841  hypothetical protein  39 
 
 		 211 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.058622  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3411  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.07 
 
 		 211 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0338117  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1043  hypothetical protein  36.79 
 
 		 200 aa  110  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000725883  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1161  hypothetical protein  39.57 
 
 		 200 aa  110  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.640197  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0384  hypothetical protein  43.92 
 
 		 209 aa  109  6e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0796  protein of unknown function DUF205  38.18 
 
 		 214 aa  109  7.000000000000001e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.348496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03451  membrane protein  38.22 
 
 		 193 aa  108  9.000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2245  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.64 
 
 		 196 aa  108  1e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.507918  normal  0.25691 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3570  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.1 
 
 		 211 aa  108  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0795951  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0793  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.42 
 
 		 213 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.414497  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5952  protein of unknown function DUF205  38.69 
 
 		 216 aa  107  3e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0934  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  44.57 
 
 		 203 aa  106  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.330103  normal  0.582468 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0533  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.83 
 
 		 198 aa  105  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1425  membrane protein  36.32 
 
 		 197 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.412084  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0753  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.07 
 
 		 214 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4789  hypothetical protein  37.62 
 
 		 226 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.120033  normal  0.994064 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0221  hypothetical protein  38.95 
 
 		 210 aa  104  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1382  hypothetical protein  35.26 
 
 		 193 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0827  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.88 
 
 		 210 aa  104  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0696875  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2109  protein of unknown function DUF205  38.81 
 
 		 200 aa  105  2e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.119956  normal  0.406872 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3662  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.7 
 
 		 203 aa  105  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.128753  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1323  hypothetical membrane spanning protein  35.26 
 
 		 193 aa  104  2e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.143303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3624  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.95 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000200164  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3630  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.95 
 
 		 198 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000615777  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2989  hypothetical protein  38.83 
 
 		 198 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15271  membrane protein  36.32 
 
 		 197 aa  103  5e-21  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1851  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  37.11 
 
 		 226 aa  103  5e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0638  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.95 
 
 		 216 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00312575  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0299  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.95 
 
 		 216 aa  102  9e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00017898  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0557  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.95 
 
 		 216 aa  102  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000206924  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3291  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.22 
 
 		 198 aa  102  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000511628  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2253  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.3 
 
 		 198 aa  102  1e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000284506  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3311  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.44 
 
 		 198 aa  100  2e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000228191  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2009  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.98 
 
 		 196 aa  101  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.401567 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1811  hypothetical protein  35.9 
 
 		 209 aa  101  2e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000443893  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0526  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.62 
 
 		 210 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.888162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2695  hypothetical protein  36.87 
 
 		 224 aa  100  3e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2693  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.32 
 
 		 193 aa  100  3e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00164513  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3399  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.44 
 
 		 198 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000706679  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00854  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.04 
 
 		 203 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3361  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.44 
 
 		 198 aa  100  4e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000818594  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15131  membrane protein  35.79 
 
 		 197 aa  100  4e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3665  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.44 
 
 		 198 aa  100  4e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000835645  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0666  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.19 
 
 		 204 aa  100  4e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2521  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  40.21 
 
 		 203 aa  100  5e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.635021 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4296  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.56 
 
 		 212 aa  99.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0033487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0898  membrane protein  37.11 
 
 		 198 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17541  membrane protein  37.11 
 
 		 198 aa  99.8  6e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3615  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.44 
 
 		 198 aa  99.8  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000137108 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1171  hypothetical protein  35.38 
 
 		 198 aa  99.8  7e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4637  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  35.9 
 
 		 192 aa  99.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.481632 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1594  acyl-phosphate glycerol-3-phosphate acyltransferase  38.86 
 
 		 212 aa  99.4  7e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.22068  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1603  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.44 
 
 		 198 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000195206 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3712  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  37.44 
 
 		 198 aa  99.4  8e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00759588  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0051  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.96 
 
 		 208 aa  99  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00859928  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0982  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  36.27 
 
 		 203 aa  99  9e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00892107  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02929  hypothetical protein  38.22 
 
 		 205 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0641  protein of unknown function DUF205  38.22 
 
 		 205 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0210247  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4339  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  34.87 
 
 		 196 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3490  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.22 
 
 		 205 aa  98.6  1e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.7848  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3128  hypothetical protein  37.97 
 
 		 190 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.154949  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02879  hypothetical protein  38.22 
 
 		 205 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00143193  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3352  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.22 
 
 		 205 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.187945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0572  membrane protein  41.01 
 
 		 200 aa  99  1e-19  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3374  hypothetical protein  37.97 
 
 		 190 aa  98.6  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2422  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  40.64 
 
 		 197 aa  98.6  1e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.130898 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3522  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.22 
 
 		 205 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.143249  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4371  putative glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsY  38.22 
 
 		 205 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.517462  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>