More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dvul_0037 on replicon NC_008751
Organism: Desulfovibrio vulgaris DP4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_0037  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  100 
 
 		 262 aa  533  1e-150  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2047  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  88.55 
 
 		 262 aa  485  1e-136  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0031  chromosome segregation ATPase  80.31 
 
 		 259 aa  442  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0017  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  77.04 
 
 		 262 aa  425  1e-118  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000000361786  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0002  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  60.71 
 
 		 270 aa  325  5e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3040  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  57.25 
 
 		 262 aa  312  2.9999999999999996e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1566  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  59.2 
 
 		 256 aa  303  2.0000000000000002e-81  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07115  SpoOJ regulator protein  58.4 
 
 		 254 aa  298  7e-80  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3139  partition protein, Par-like  54.8 
 
 		 254 aa  295  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3413  chromosome segregation ATPase  55.47 
 
 		 257 aa  290  2e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0202  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  56.86 
 
 		 255 aa  290  2e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0106  soj protein  55.47 
 
 		 257 aa  289  3e-77  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4256  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.94 
 
 		 257 aa  289  3e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000382453  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3532  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.23 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.440443  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2941  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.18 
 
 		 255 aa  285  4e-76  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4042  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  54.15 
 
 		 257 aa  285  5.999999999999999e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.211181 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2031  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.31 
 
 		 273 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.488481 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3957  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.75 
 
 		 257 aa  283  2.0000000000000002e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000240615  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2568  sporulation initiation inhibitor protein  52.38 
 
 		 260 aa  283  2.0000000000000002e-75  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0143069  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3553  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.16 
 
 		 253 aa  282  4.0000000000000003e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3425  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  55.56 
 
 		 253 aa  281  5.000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4020  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.2 
 
 		 253 aa  281  5.000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3321  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  54.8 
 
 		 253 aa  281  9e-75  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5273  cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.6 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5177  sporulation initiation inhibitor  53.2 
 
 		 253 aa  280  2e-74  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5631  sporulation initiation inhibitor protein Soj  53.2 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5328  sporulation initiation inhibitor protein Soj  53.2 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000106044 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5333  sporulation initiation inhibitor protein Soj  53.2 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5161  sporulation initiation inhibitor  53.2 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5667  sporulation initiation inhibitor protein Soj  53.2 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5730  sporulation initiation inhibitor protein Soj  53.2 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5590  sporulation initiation inhibitor protein Soj  53.2 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000114742 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5607  sporulation initiation inhibitor protein Soj  53.2 
 
 		 253 aa  279  3e-74  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.907427  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2848  chromosome segregation ATPase  55.65 
 
 		 259 aa  279  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.978745  normal  0.176776 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0928  chromosome segregation ATPase  52.14 
 
 		 255 aa  278  9e-74  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3177  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.75 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2560  chromosome segregation ATPase  52.96 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00888291  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2377  chromosome segregation ATPase  52.8 
 
 		 258 aa  275  7e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2087  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.1 
 
 		 265 aa  275  7e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23520  chromosome segregation ATPase  53.47 
 
 		 249 aa  274  1.0000000000000001e-72  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.502901  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1156  ParA family chromosome partitioning ATPase  52.73 
 
 		 256 aa  274  1.0000000000000001e-72  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.523363  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14150  chromosome segregation ATPase  54.4 
 
 		 294 aa  273  3e-72  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0861  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.55 
 
 		 262 aa  271  7e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3117  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.59 
 
 		 294 aa  271  8.000000000000001e-72  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.746498  hitchhiker  0.000000304833 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2926  chromosome segregation ATPase  54.4 
 
 		 253 aa  270  1e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2097  chromosome segregation ATPase  52.96 
 
 		 265 aa  270  1e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0206  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.6 
 
 		 262 aa  270  2e-71  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0134114  normal  0.146829 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2056  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.57 
 
 		 265 aa  269  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4386  chromosome partitioning protein  50 
 
 		 264 aa  269  2.9999999999999997e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0452  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.6 
 
 		 295 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.402264  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2146  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.97 
 
 		 254 aa  269  4e-71  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2059  chromosome partitioning protein ParA  51.74 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1979  chromosome partitioning protein ParA  51.74 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1803  ParaA family ATPase  53.6 
 
 		 265 aa  268  5e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.833868  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0583  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  51.38 
 
 		 257 aa  268  5e-71  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0322  ParaA family ATPase  52.17 
 
 		 265 aa  268  7e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.0112363 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4355  chromosome segregation ATPase  52.78 
 
 		 275 aa  268  8.999999999999999e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.901478  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1888  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  53.2 
 
 		 265 aa  267  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2516  chromosome segregation ATPase  53.6 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00725558  hitchhiker  0.00179458 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4809  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.98 
 
 		 257 aa  266  2.9999999999999995e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5026  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.39 
 
 		 270 aa  266  2.9999999999999995e-70  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4491  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.38 
 
 		 259 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0134  chromosome segregation ATPase  50.59 
 
 		 258 aa  265  4e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4510  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.38 
 
 		 259 aa  265  4e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_28490  chromosome segregation ATPase  52 
 
 		 348 aa  265  5.999999999999999e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.150947  hitchhiker  0.00113188 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0241  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.99 
 
 		 300 aa  265  5.999999999999999e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.811562  normal  0.0256625 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2439  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.78 
 
 		 265 aa  263  2e-69  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0355  cobyrinic acid ac-diamide synthase  52.61 
 
 		 266 aa  263  2e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.512041 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0288  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.24 
 
 		 284 aa  263  2e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.949249 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0103  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.81 
 
 		 286 aa  263  2e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4502  cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.76 
 
 		 314 aa  263  2e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.497857 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4254  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.59 
 
 		 264 aa  263  2e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.645482 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3928  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.8 
 
 		 264 aa  263  3e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.436902  normal  0.478463 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2404  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50 
 
 		 255 aa  263  3e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0095  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.24 
 
 		 289 aa  263  3e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0663654 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1864  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.78 
 
 		 286 aa  262  4e-69  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.238573  normal  0.0904624 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1585  cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.78 
 
 		 286 aa  262  4e-69  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0495676 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4362  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50.4 
 
 		 253 aa  261  6e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0007  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  51.6 
 
 		 257 aa  261  6e-69  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0294  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.81 
 
 		 284 aa  261  1e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.163786  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0106  chromosome segregation ATPase  50.8 
 
 		 256 aa  260  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00135842  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0142  SpoOJ regulator protein  50 
 
 		 258 aa  259  3e-68  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1654  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  50 
 
 		 286 aa  259  3e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0980496  normal  0.386611 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0167  chromosome segregation ATPase  49.06 
 
 		 283 aa  259  3e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.463835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0116  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.6 
 
 		 268 aa  259  4e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3884  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.04 
 
 		 264 aa  259  4e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0503158  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3202  cobyrinic acid ac-diamide synthase  48.84 
 
 		 264 aa  258  5.0000000000000005e-68  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02930  chromosome partitioning protein  50.59 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.7551  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2768  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  48.41 
 
 		 270 aa  257  1e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00658923  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1937  Cobyrinic acid ac-diamide synthase  49.06 
 
 		 265 aa  257  1e-67  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0003  ParA family protein  47.69 
 
 		 262 aa  256  2e-67  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.458179  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0432  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.43 
 
 		 284 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2439  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  50.19 
 
 		 264 aa  257  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0305586  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3627  chromosome segregation ATPase  49.6 
 
 		 276 aa  256  3e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.583516  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0389  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  49.43 
 
 		 271 aa  256  3e-67  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04092  transcriptional regulator of chromosome partitioning protein; ParA family protein; could be a protein tyrosine kinase  45.98 
 
 		 264 aa  255  4e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.291675  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3965  cobyrinic acid a,c-diamide synthase  45.77 
 
 		 262 aa  255  5e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.168488  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3469  chromosome segregation ATPase  48.08 
 
 		 264 aa  255  5e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3934  chromosome segregation ATPase  45.77 
 
 		 262 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0378841  hitchhiker  0.00270556 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4026  chromosome segregation ATPase  45.77 
 
 		 262 aa  254  9e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.270121  normal  0.883102 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>