44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1639 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  100 
 
 		 918 aa  1867    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3721  hypothetical protein  24.52 
 
 		 774 aa  107  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.492236  normal  0.337138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  23.75 
 
 		 1171 aa  102  4e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6657  hypothetical protein  22.73 
 
 		 782 aa  85.5  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121029  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  23.65 
 
 		 2140 aa  84  0.00000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3534  hypothetical protein  26.61 
 
 		 1438 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  24.63 
 
 		 3286 aa  82.8  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  23.96 
 
 		 3238 aa  82  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  23.48 
 
 		 3006 aa  80.9  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1133 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  23.96 
 
 		 3521 aa  77.8  0.0000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  23.79 
 
 		 2899 aa  77  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  24.84 
 
 		 1644 aa  76.3  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  23.29 
 
 		 2900 aa  72  0.00000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2984  tail fiber protein  23.71 
 
 		 1111 aa  71.2  0.00000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  21.1 
 
 		 1061 aa  70.9  0.0000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  22.42 
 
 		 1120 aa  68.6  0.0000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  20.86 
 
 		 1159 aa  66.2  0.000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  22.47 
 
 		 1120 aa  66.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  20.86 
 
 		 1132 aa  64.3  0.00000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  21.39 
 
 		 1132 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  21.39 
 
 		 1132 aa  63.5  0.00000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  21.94 
 
 		 1051 aa  61.6  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  22.41 
 
 		 1219 aa  61.6  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  20.98 
 
 		 1159 aa  61.2  0.00000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  21.18 
 
 		 1137 aa  60.5  0.0000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  22.19 
 
 		 1057 aa  60.1  0.0000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1158 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  22.12 
 
 		 1158 aa  58.5  0.0000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  22.2 
 
 		 1221 aa  58.5  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  19.2 
 
 		 1543 aa  58.2  0.0000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  22.74 
 
 		 1100 aa  57  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  21.88 
 
 		 1059 aa  57  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  21.65 
 
 		 1159 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  22.01 
 
 		 1157 aa  56.6  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  22.01 
 
 		 1159 aa  55.8  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  22.53 
 
 		 1101 aa  54.7  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  21.41 
 
 		 1157 aa  54.7  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  21.96 
 
 		 1157 aa  54.3  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  21.17 
 
 		 522 aa  51.2  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  23.08 
 
 		 1116 aa  49.3  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  23.08 
 
 		 1116 aa  49.3  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  20.31 
 
 		 1012 aa  45.8  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  21.25 
 
 		 1092 aa  44.3  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>