More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0416 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008751  Dvul_1329  PEP-utilising enzyme, mobile region  86.66 
 
 		 1191 aa  2130    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.110408 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0874  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  72.61 
 
 		 1197 aa  1779    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0416  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  100 
 
 		 1192 aa  2449    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0134571 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2080  phosphoenolpyruvate synthase  81.49 
 
 		 1194 aa  2036    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0332499  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0691  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate- binding  71.5 
 
 		 1193 aa  1779    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.145468 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1552  pyruvate phosphate dikinase PEP/pyruvate-binding  75.99 
 
 		 1191 aa  1891    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.014569  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1946  pyruvate, water dikinase  35.23 
 
 		 1115 aa  303  9e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.558692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4209  phosphoenolpyruvate synthase  34.76 
 
 		 825 aa  241  5e-62  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.390448 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0621  phosphoenolpyruvate synthase  34.85 
 
 		 793 aa  236  2.0000000000000002e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.200642  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0838  phosphoenolpyruvate synthase  32.71 
 
 		 795 aa  228  5.0000000000000005e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2655  phosphoenolpyruvate synthase  44.48 
 
 		 788 aa  228  5.0000000000000005e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.00600909  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0867  phosphoenolpyruvate synthase  33.79 
 
 		 795 aa  227  1e-57  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4569  phosphoenolpyruvate synthase  33.21 
 
 		 821 aa  224  6e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1335  phosphoenolpyruvate synthase  30.77 
 
 		 794 aa  224  9e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000416419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0949  phosphoenolpyruvate synthase  32.45 
 
 		 795 aa  224  9.999999999999999e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000263208  normal  0.0247077 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1694  phosphoenolpyruvate synthase  33.09 
 
 		 779 aa  223  9.999999999999999e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.434121 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2934  phosphoenolpyruvate synthase  33.91 
 
 		 789 aa  223  1.9999999999999999e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1054  phosphoenolpyruvate synthase  33.88 
 
 		 809 aa  223  1.9999999999999999e-56  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1034  phosphoenolpyruvate synthase  30.61 
 
 		 794 aa  223  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00422574  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3841  phosphoenolpyruvate synthase  34.39 
 
 		 819 aa  222  3.9999999999999997e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00922  phosphoenolpyruvate synthase  33.06 
 
 		 797 aa  221  5e-56  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0899613  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1883  phosphoenolpyruvate synthase  34.27 
 
 		 778 aa  221  8.999999999999998e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.479311  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2577  phosphoenolpyruvate synthase  34.55 
 
 		 790 aa  219  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.395998 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0212  phosphoenolpyruvate synthase  33.98 
 
 		 803 aa  219  2.9999999999999998e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0593  phosphoenolpyruvate synthase  33.4 
 
 		 799 aa  219  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.230146  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2428  phosphoenolpyruvate synthase  33.91 
 
 		 786 aa  218  5.9999999999999996e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3966  phosphoenolpyruvate synthase  32.78 
 
 		 793 aa  217  9.999999999999999e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0173  phosphoenolpyruvate synthase  33.27 
 
 		 812 aa  216  1.9999999999999998e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2549  phosphoenolpyruvate synthase  34.16 
 
 		 789 aa  216  1.9999999999999998e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00670387  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0220  phosphoenolpyruvate synthase  33.27 
 
 		 790 aa  215  3.9999999999999995e-54  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.556806  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0548  phosphoenolpyruvate synthase  32.99 
 
 		 799 aa  215  3.9999999999999995e-54  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.485187  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1745  phosphoenolpyruvate synthase  41.2 
 
 		 792 aa  214  4.9999999999999996e-54  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0182067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0998  phosphoenolpyruvate synthase  33.63 
 
 		 787 aa  215  4.9999999999999996e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1843  phosphoenolpyruvate synthase  33.27 
 
 		 794 aa  214  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1657  phosphoenolpyruvate synthase  34.06 
 
 		 792 aa  214  5.999999999999999e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2203  phosphoenolpyruvate synthase  42.03 
 
 		 789 aa  214  5.999999999999999e-54  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000184256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2600  phosphoenolpyruvate synthase  33.27 
 
 		 794 aa  214  5.999999999999999e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1737  phosphoenolpyruvate synthase  33.27 
 
 		 794 aa  214  5.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2223  phosphoenolpyruvate synthase  32.75 
 
 		 815 aa  214  7.999999999999999e-54  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.442337  normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1888  phosphoenolpyruvate synthase  33.01 
 
 		 809 aa  213  1e-53  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01671  phosphoenolpyruvate synthase  40.86 
 
 		 792 aa  213  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.437893  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1940  phosphoenolpyruvate synthase  40.86 
 
 		 792 aa  213  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.887116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01660  hypothetical protein  40.86 
 
 		 792 aa  213  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.417356  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1781  phosphoenolpyruvate synthase  40.86 
 
 		 792 aa  213  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1905  phosphoenolpyruvate synthase  40.86 
 
 		 792 aa  213  2e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1929  phosphoenolpyruvate synthase  40.86 
 
 		 792 aa  213  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217189  normal  0.175873 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1489  phosphoenolpyruvate synthase  41 
 
 		 792 aa  213  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1919  phosphoenolpyruvate synthase  40.86 
 
 		 792 aa  213  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2419  phosphoenolpyruvate synthase  40.86 
 
 		 792 aa  213  2e-53  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1835  phosphoenolpyruvate synthase  32.2 
 
 		 832 aa  213  2e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2080  phosphoenolpyruvate synthase  33.93 
 
 		 804 aa  212  3e-53  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000171715 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06517  phosphoenolpyruvate synthase  40.94 
 
 		 795 aa  212  4e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1823  phosphoenolpyruvate synthase  40.86 
 
 		 792 aa  212  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1445  phosphoenolpyruvate synthase  40.86 
 
 		 792 aa  212  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.732195  normal  0.149027 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1770  phosphoenolpyruvate synthase  33.47 
 
 		 791 aa  212  4e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1744  phosphoenolpyruvate synthase  39.2 
 
 		 791 aa  212  4e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1995  phosphoenolpyruvate synthase  40.86 
 
 		 792 aa  212  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.367287  normal  0.176053 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1461  phosphoenolpyruvate synthase  40.86 
 
 		 792 aa  212  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1479  phosphoenolpyruvate synthase  40.86 
 
 		 792 aa  212  4e-53  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.328062  normal  0.259297 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2085  phosphoenolpyruvate synthase  33.6 
 
 		 790 aa  211  9e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.213037  normal  0.122816 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2010  phosphoenolpyruvate synthase  32.5 
 
 		 837 aa  211  9e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3011  phosphoenolpyruvate synthase  35.37 
 
 		 795 aa  210  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000648  phosphoenolpyruvate synthase  40.2 
 
 		 790 aa  210  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.45337  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0998  phosphoenolpyruvate synthase  42.2 
 
 		 795 aa  209  2e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0490336  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0121  phosphoenolpyruvate synthase  36.57 
 
 		 800 aa  210  2e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0799  phosphoenolpyruvate synthase  31.72 
 
 		 801 aa  209  2e-52  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0251  phosphoenolpyruvate synthase  33.08 
 
 		 803 aa  209  2e-52  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1768  phosphoenolpyruvate synthase  43.46 
 
 		 791 aa  209  3e-52  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.513341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0770  phosphoenolpyruvate synthase  34.6 
 
 		 800 aa  209  3e-52  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5940  phosphoenolpyruvate synthase  35.34 
 
 		 803 aa  209  3e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2466  phosphoenolpyruvate synthase  30.16 
 
 		 782 aa  208  4e-52  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.407223  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2456  phosphoenolpyruvate synthase  32.5 
 
 		 792 aa  208  4e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3094  phosphoenolpyruvate synthase  33.53 
 
 		 803 aa  207  7e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.421568  normal  0.0476664 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3536  phosphoenolpyruvate synthase  33.73 
 
 		 792 aa  207  7e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2366  phosphoenolpyruvate synthase  33.73 
 
 		 796 aa  207  8e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2879  phosphoenolpyruvate synthase  33.73 
 
 		 796 aa  207  8e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.286531  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0803  phosphoenolpyruvate synthase  34.4 
 
 		 805 aa  207  9e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2758  phosphoenolpyruvate synthase  32.5 
 
 		 792 aa  207  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02382  phosphoenolpyruvate synthase  32.65 
 
 		 790 aa  207  1e-51  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.223417  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2297  phosphoenolpyruvate synthase  31.85 
 
 		 808 aa  207  1e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.00000505096  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41670  phosphoenolpyruvate synthase  33.73 
 
 		 791 aa  207  1e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2082  phosphoenolpyruvate synthase  39.06 
 
 		 791 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.665806  normal  0.0194263 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0313  phosphoenolpyruvate synthase  33.4 
 
 		 809 aa  206  2e-51  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2292  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 791 aa  206  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.400627  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23280  phosphoenolpyruvate synthase  33.73 
 
 		 790 aa  206  2e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1600  phosphoenolpyruvate synthase  39.06 
 
 		 791 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000263384 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3658  phosphoenolpyruvate synthase  33.54 
 
 		 791 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.224142  normal  0.417276 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2644  phosphoenolpyruvate synthase  32.67 
 
 		 789 aa  206  3e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0972  phosphoenolpyruvate synthase  29.57 
 
 		 790 aa  206  3e-51  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.687633  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2090  phosphoenolpyruvate synthase  40 
 
 		 791 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.721181  hitchhiker  0.00522752 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1593  phosphoenolpyruvate synthase  39.06 
 
 		 791 aa  206  3e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.313637  normal  0.0743943 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1890  phosphoenolpyruvate synthase  31.99 
 
 		 815 aa  206  3e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  0.186411 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2422  phosphoenolpyruvate synthase  32.27 
 
 		 792 aa  205  4e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.052092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1689  phosphoenolpyruvate synthase  31.41 
 
 		 792 aa  205  4e-51  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3073  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 806 aa  205  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1549  phosphoenolpyruvate synthase  33.33 
 
 		 789 aa  204  6e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0036639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1405  phosphoenolpyruvate synthase  32.77 
 
 		 798 aa  204  6e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.640066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2864  phosphoenolpyruvate synthase  32.26 
 
 		 839 aa  204  7e-51  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00890686  decreased coverage  0.000201975 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1298  phosphoenolpyruvate synthase  34.26 
 
 		 795 aa  204  7e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.432708  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3257  phosphoenolpyruvate synthase  32.26 
 
 		 839 aa  204  8e-51  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>