More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2588 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009952  Dshi_2588  putative esterase/lipase  100 
 
 
298 aa  586  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00226439 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2666  Alpha/beta hydrolase fold-3  43.69 
 
 
293 aa  188  8e-47  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.141975 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1347  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.32 
 
 
299 aa  159  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00373411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4691  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  48.74 
 
 
314 aa  158  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.123094  normal  0.0800225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4547  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  43.03 
 
 
304 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.892328  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1891  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  43.65 
 
 
309 aa  154  2e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0517775  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0126  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.36 
 
 
312 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.586545  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4178  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.83 
 
 
311 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.484378  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0870  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.99 
 
 
310 aa  153  4e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.53129  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5450  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.3 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.252353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1513  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.59 
 
 
325 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.231779  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1536  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.59 
 
 
298 aa  149  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2823  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.21 
 
 
297 aa  145  9e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2885  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.81 
 
 
303 aa  143  3e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1370  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.22 
 
 
347 aa  142  9e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3187  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.26 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.471576  normal  0.966614 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1475  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.89 
 
 
347 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.298032  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0700  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  39.92 
 
 
299 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0356506  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3541  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.85 
 
 
301 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1535  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.17 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.627335  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1558  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.17 
 
 
320 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0483027  normal 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6042  esterase/lipase/thioesterase  35.86 
 
 
297 aa  139  4.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5566  Alpha/beta hydrolase fold-3  32.78 
 
 
300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211094  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42 
 
 
297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.392669  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2945  Alpha/beta hydrolase fold-3  34.29 
 
 
287 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0188247  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4571  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.92 
 
 
296 aa  133  5e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421006  normal  0.0237721 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8210  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.2 
 
 
300 aa  132  6.999999999999999e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2509  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  33.88 
 
 
323 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00312787  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0233  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.06 
 
 
293 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1047  putative lipase/esterase  36.96 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.405322  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1328  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.69 
 
 
296 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.87355  normal  0.418468 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1529  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.33 
 
 
296 aa  129  7.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4628  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  31.01 
 
 
272 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.596943  normal  0.391369 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4574  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  37.84 
 
 
561 aa  127  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.327583  normal  0.0891071 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2797  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.43 
 
 
320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1055  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  36.86 
 
 
298 aa  126  4.0000000000000003e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0629  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.05 
 
 
302 aa  125  7e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.211624  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0552  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.79 
 
 
322 aa  124  1e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0635  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  39.39 
 
 
318 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.489635  normal  0.18119 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0439  putative lipase/esterase protein  39.47 
 
 
317 aa  122  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.681121 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37370  putative esterase  38.52 
 
 
309 aa  122  9e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000409055  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1618  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.79 
 
 
306 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0114623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2664  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  41.23 
 
 
320 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2416  Alpha/beta hydrolase fold-3  33.57 
 
 
354 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.953049  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0348  Alpha/beta hydrolase  34.3 
 
 
335 aa  119  9e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.665109  normal  0.220005 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0854  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.46 
 
 
319 aa  119  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.029888  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6075  lipolytic protein  40.28 
 
 
320 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.586519 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3202  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.89 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.113796  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3193  Alpha/beta hydrolase fold-3  36.89 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.24415  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3255  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.89 
 
 
318 aa  118  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.124848  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2071  alpha/beta hydrolase fold protein-3 domain protein  35.2 
 
 
321 aa  118  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0649  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.03 
 
 
294 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0175404 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0652  putative acetyl-hydrolase  39.65 
 
 
321 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2135  Alpha/beta hydrolase fold-3  40.28 
 
 
320 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2747  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.28 
 
 
320 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12410  acetyl hydrolase mbtJ  35.37 
 
 
306 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.492248  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0360  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  42.36 
 
 
316 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2426  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain-containing protein  34.26 
 
 
308 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.64588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4064  putative lipase/esterase  37.45 
 
 
318 aa  115  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.402424  normal  0.850299 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2773  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  40.28 
 
 
320 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3685  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.59 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.815871  hitchhiker  0.000302212 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0668  putative acetyl-hydrolase  39.21 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2776  putative esterase  39.21 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0171  esterase, putative  39.21 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0827  esterase, putative  39.21 
 
 
321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2016  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  32.64 
 
 
341 aa  114  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2303  putative esterase  39.21 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.68218  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2383  putative acetyl-hydrolase  39.21 
 
 
315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4606  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  38.57 
 
 
320 aa  110  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3516  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.32 
 
 
328 aa  110  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13101  acetyl-hydrolase/esterase lipR  35.66 
 
 
308 aa  109  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2165  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.2 
 
 
349 aa  109  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.690689  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0117  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  34.53 
 
 
361 aa  108  7.000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.122619  n/a   
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5125  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  33.98 
 
 
305 aa  108  1e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1687  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.92 
 
 
308 aa  108  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.234776  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2514  lipolytic protein  35.96 
 
 
816 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24723  normal  0.637909 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2263  acetyl hydrolase, putative  31.89 
 
 
304 aa  106  4e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4277  esterase/lipase/thioesterase family protein  31.08 
 
 
277 aa  105  9e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0641  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  37.87 
 
 
297 aa  104  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0654792  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3881  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.68 
 
 
303 aa  104  2e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2509  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  31.48 
 
 
369 aa  103  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1999  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.08 
 
 
352 aa  103  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.027865 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1086  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  39.46 
 
 
305 aa  102  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0217904  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4453  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.29 
 
 
317 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0539  esterase, putative  40.53 
 
 
321 aa  101  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0451  Alpha/beta hydrolase fold-3  37.17 
 
 
298 aa  101  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1476  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  29.48 
 
 
298 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3698  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  35.27 
 
 
303 aa  100  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.242703  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0384  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  29.62 
 
 
372 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1807  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.3 
 
 
306 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3755  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.27 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0570  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  35.62 
 
 
303 aa  99.8  5e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0330  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.5 
 
 
323 aa  99.8  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0315  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  38.67 
 
 
323 aa  99.4  7e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.732601  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4381  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.99 
 
 
350 aa  99  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2358  lipase/esterase  34.36 
 
 
306 aa  98.2  1e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00629855  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3607  Alpha/beta hydrolase fold-3 domain protein  37.28 
 
 
396 aa  98.2  1e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.42259 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4150  Alpha/beta hydrolase fold-3  30.99 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0644  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  36.32 
 
 
303 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4225  alpha/beta hydrolase domain-containing protein  30.99 
 
 
350 aa  98.6  1e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.604288  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>