31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2501 on replicon NC_013224
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013224  Dret_2501  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  152  2e-36  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2511  hypothetical protein  70.27 
 
 		 75 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.526212 
 
 
-
 
NC_008762  Pnap_4979  hypothetical protein  56.94 
 
 		 77 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6458  hypothetical protein  56.1 
 
 		 100 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal  0.785876 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8426  hypothetical protein  44.64 
 
 		 70 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.237227  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0688  hypothetical protein  35.53 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3523  hypothetical protein  35.06 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1290  hypothetical protein  36.36 
 
 		 87 aa  46.6  0.0001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1880  hypothetical protein  35.06 
 
 		 90 aa  46.6  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.616316  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1256  hypothetical protein  35.06 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.128186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2604  hypothetical protein  34.21 
 
 		 94 aa  45.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.336669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1265  hypothetical protein  33.77 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4168  hypothetical protein  33.77 
 
 		 80 aa  45.4  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2622  hypothetical protein  36.36 
 
 		 87 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.0019898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3862  hypothetical protein  52.5 
 
 		 88 aa  44.7  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3434  hypothetical protein  35.21 
 
 		 70 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.598979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35960  hypothetical protein  32.89 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2719  hypothetical protein  34.21 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.30261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3022  hypothetical protein  34.21 
 
 		 87 aa  43.5  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0572559 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0708  hypothetical protein  38.81 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0456  hypothetical protein  32.89 
 
 		 91 aa  43.5  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.743505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2931  hypothetical protein  33.77 
 
 		 91 aa  42.7  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.263306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2656  hypothetical protein  32.47 
 
 		 95 aa  43.5  0.001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.863688  normal  0.251064 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1032  hypothetical protein  38.89 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7433  hypothetical protein  38.98 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.634983 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3533  hypothetical protein  37.84 
 
 		 83 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1202  hypothetical protein  37.84 
 
 		 83 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2331  hypothetical protein  32.47 
 
 		 87 aa  41.2  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011882  Cyan7425_5280  CopG domain protein DNA-binding domain protein  38.81 
 
 		 99 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.485225  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2800  hypothetical protein  44.44 
 
 		 84 aa  40  0.009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.538676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2335  hypothetical protein  37.93 
 
 		 84 aa  40  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.179568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>