13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1194 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_1194  Auxin Efflux Carrier  100 
 
 		 318 aa  617  1e-176  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1077  auxin efflux carrier  22.62 
 
 		 306 aa  81.3  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2443  Auxin Efflux Carrier  25.17 
 
 		 305 aa  58.2  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0121  auxin efflux carrier  24.92 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2072  AEC family permease  26.11 
 
 		 297 aa  53.5  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1252  auxin efflux carrier  23.29 
 
 		 361 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000147214  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1563  malate permease  22.29 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00482398  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0478  malate permease related permease  21.05 
 
 		 313 aa  47.4  0.0004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.557877  normal  0.943371 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0742  Auxin Efflux Carrier  23.51 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.678682 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0492  auxin efflux carrier  21.78 
 
 		 304 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.369928  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1504  auxin efflux carrier  23.08 
 
 		 315 aa  43.9  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0236  AEC family permease  20.43 
 
 		 312 aa  43.1  0.006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000077424  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1575  auxin efflux carrier  22.77 
 
 		 304 aa  42.7  0.009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>