14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0628 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0628  TPR repeat-containing protein  100 
 
 		 168 aa  337  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0492452  hitchhiker  0.000000131478 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3375  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.01 
 
 		 306 aa  52  0.000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.110631  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3337  TPR repeat-containing protein  25.86 
 
 		 361 aa  47.8  0.00007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0785  TPR repeat-containing protein  25.66 
 
 		 796 aa  45.1  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.225465  hitchhiker  0.00421983 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2549  hypothetical protein  26.32 
 
 		 577 aa  43.9  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  25.78 
 
 		 3145 aa  43.9  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5036  tetratricopeptide TPR_2  27.2 
 
 		 288 aa  43.1  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0840723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1965  TPR repeat-containing protein  29.41 
 
 		 595 aa  43.1  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.546614  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2405  hypothetical protein  30.93 
 
 		 577 aa  42.4  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0504  TPR repeat-containing protein  23.68 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4282  TPR repeat-containing protein  24.83 
 
 		 715 aa  42.4  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3814  TPR repeat-containing protein  27.69 
 
 		 615 aa  42.4  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2671  tetratricopeptide TPR_2  27.74 
 
 		 828 aa  40.8  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.290452  normal  0.798665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4342  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 1406 aa  40.8  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.603254  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>