27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_0496 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_0496  protein of unknown function DUF448  100 
 
 		 86 aa  179  1e-44  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.85619 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2432  hypothetical protein  60.29 
 
 		 76 aa  86.3  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.489483  normal  0.511781 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2514  hypothetical protein  51.39 
 
 		 83 aa  72  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2413  hypothetical protein  46.27 
 
 		 69 aa  68.2  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0060  protein of unknown function DUF448  52.86 
 
 		 81 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0709  protein of unknown function DUF448  51.85 
 
 		 98 aa  56.6  0.0000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1474  protein of unknown function DUF448  46.88 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00145328  unclonable  0.00000273772 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2317  protein of unknown function DUF448  47.37 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000982991  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1516  hypothetical protein  45.45 
 
 		 113 aa  51.6  0.000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.665046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0898  hypothetical protein  46.03 
 
 		 93 aa  51.6  0.000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0615724  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3750  hypothetical protein  53.85 
 
 		 118 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00136006  unclonable  0.0000107528 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07830  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  37.14 
 
 		 90 aa  50.1  0.000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0474  hypothetical protein  48.08 
 
 		 107 aa  47.8  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000988639  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1369  hypothetical protein  41.94 
 
 		 110 aa  47  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.101372  normal  0.315015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1326  hypothetical protein  41.94 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.940508  normal  0.0110946 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3682  protein of unknown function DUF448  46.15 
 
 		 108 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000895939  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_10310  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  33.77 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.277899  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1587  ribosomal protein L7Ae family protein  35.82 
 
 		 205 aa  44.3  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00501586  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1664  protein of unknown function DUF448  40 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000838952  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1048  hypothetical protein  38.71 
 
 		 93 aa  43.5  0.0009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000000486204  unclonable  0.00000000911443 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1133  hypothetical protein  48.08 
 
 		 104 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.0000628403  normal  0.789236 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14560  predicted nucleic-acid-binding protein implicated in transcription termination  34.72 
 
 		 119 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  decreased coverage  0.00191039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1235  hypothetical protein  43.08 
 
 		 93 aa  42  0.003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.0000252033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3190  protein of unknown function DUF448  35.48 
 
 		 89 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.000000000866759  normal  0.144703 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0608  protein of unknown function DUF448  42 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000166199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3191  hypothetical protein  39.62 
 
 		 121 aa  40.8  0.006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0484854  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0984  hypothetical protein  44 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0693423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>