102 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2774 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_2774  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  100 
 
 
266 aa  552  1e-156  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000890852  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1516  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  38.58 
 
 
269 aa  213  1.9999999999999998e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0739061  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1321  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  35.11 
 
 
252 aa  185  8e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0530  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.55 
 
 
289 aa  71.2  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2764  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.45 
 
 
291 aa  71.6  0.00000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.0000220689  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1959  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  28.12 
 
 
294 aa  70.9  0.00000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.233255 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2413  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.79 
 
 
276 aa  68.9  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0113  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  27.27 
 
 
283 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02713  predicted oxidoreductase  26.04 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02675  hypothetical protein  26.04 
 
 
259 aa  65.5  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0342  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  26.1 
 
 
288 aa  65.1  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.461873 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3206  putative selenate reductase subunit YgfM  25.76 
 
 
259 aa  64.7  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1733  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.8 
 
 
292 aa  65.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0812  selenate reductase, FAD-binding subunit  26.04 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3040  putative selenate reductase subunit YgfM  26.04 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3013  putative selenate reductase subunit YgfM  26.04 
 
 
259 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4170  putative selenate reductase subunit YgfM  26.04 
 
 
259 aa  64.7  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0029  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  28.78 
 
 
288 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.275591 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1525  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.76 
 
 
278 aa  61.6  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.949472 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4317  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.45 
 
 
286 aa  60.5  0.00000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.901024  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0841  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.37 
 
 
288 aa  59.3  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.23695  hitchhiker  0.00000381307 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4005  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.82 
 
 
287 aa  59.3  0.00000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.218277  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20080  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  28.95 
 
 
272 aa  58.9  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0549265  hitchhiker  0.0021832 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2837  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.94 
 
 
288 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0609  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.91 
 
 
278 aa  58.5  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.515011  normal  0.94537 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4414  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.69 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.939465  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0828  putative selenate reductase subunit YgfM  26.92 
 
 
259 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1360  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.45 
 
 
291 aa  57.8  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.277831  normal  0.0179575 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2232  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.36 
 
 
288 aa  57.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.894157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1819  medium FAD-binding subunit of molybdenum enzyme  24.72 
 
 
280 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2185  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.69 
 
 
292 aa  56.6  0.0000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.27538  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4236  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  23.94 
 
 
285 aa  56.2  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4663  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.18 
 
 
276 aa  56.6  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.795711  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3074  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding:CO dehydrogenase flavoprotein, C-terminal  26.88 
 
 
294 aa  55.8  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3872  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.1 
 
 
285 aa  55.5  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.537266 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4923  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.17 
 
 
285 aa  55.5  0.0000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.514646  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1738  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  23.32 
 
 
305 aa  54.7  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0473  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25.37 
 
 
276 aa  54.3  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0238  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  27.47 
 
 
278 aa  53.1  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2204  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.79 
 
 
268 aa  52.8  0.000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0765762  normal  0.959304 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6765  (2Fe-2S)-binding domain protein  26.36 
 
 
470 aa  52.8  0.000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2698  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.89 
 
 
275 aa  52.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0195145  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.34 
 
 
304 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2833  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.59 
 
 
492 aa  52  0.000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0594  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.91 
 
 
283 aa  52  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3968  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  24.91 
 
 
284 aa  52  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4104  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  25.27 
 
 
289 aa  52  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.507155  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2646  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.1 
 
 
283 aa  52  0.000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1562  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  25.09 
 
 
289 aa  51.2  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.915322 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3948  hypothetical protein  27.4 
 
 
485 aa  51.6  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.804932  normal  0.121566 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1568  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.77 
 
 
269 aa  52  0.00001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.623716  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2002  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  26.74 
 
 
290 aa  52  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1512  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.83 
 
 
282 aa  51.2  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0974  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  26.74 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00101197  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2144  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  26.47 
 
 
288 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.102712 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0451  xanthine dehydrogenase small subunit  24.13 
 
 
496 aa  50.4  0.00003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.608502  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2861  xanthine dehydrogenase, small subunit  25.09 
 
 
488 aa  50.4  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0406506  normal  0.82137 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2153  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.99 
 
 
292 aa  50.1  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.891805 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4811  putative oxidoreductase subunit  31.76 
 
 
273 aa  49.7  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1946  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25.67 
 
 
263 aa  49.3  0.00006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.00353773  normal  0.723918 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1423  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  24.24 
 
 
295 aa  49.3  0.00006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0349  xanthine dehydrogenase, putative  24.16 
 
 
492 aa  49.3  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2010  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  27.4 
 
 
284 aa  49.3  0.00007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1871  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  22.1 
 
 
287 aa  48.9  0.00008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00397526  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3133  xanthine dehydrogenase, small subunit  24.82 
 
 
488 aa  48.9  0.00009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.207802  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3554  xanthine dehydrogenase, small subunit  25.09 
 
 
485 aa  48.5  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3237  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28 
 
 
485 aa  48.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.492862  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1502  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  28.37 
 
 
287 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0365  xanthine dehydrogenase, small subunit  24.16 
 
 
492 aa  48.5  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0448  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  22.5 
 
 
282 aa  47.8  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.221209  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0299  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  22.42 
 
 
280 aa  47.4  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2635  carbon monoxide dehydrogenase medium subunit  25.87 
 
 
300 aa  48.1  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1633  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  22.99 
 
 
241 aa  47.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.431069  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1982  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.42 
 
 
281 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.69228  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0860  xanthine dehydrogenase, small subunit  24.54 
 
 
504 aa  47  0.0003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.588743  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2704  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25.44 
 
 
487 aa  46.6  0.0004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.299034 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1784  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.26 
 
 
272 aa  46.6  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5317  putative carbon monoxide dehydrogenase medium subunit, coxM-like protein  23.16 
 
 
289 aa  46.6  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.410133 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1210  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  24.26 
 
 
284 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0358548  normal  0.452165 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2958  putative xanthine dehydrogenase  29.66 
 
 
483 aa  46.6  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0528227 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2587  molybdopterin dehydrogenase  26.91 
 
 
287 aa  46.2  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.551287  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3113  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  22.89 
 
 
290 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.203771  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1632  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  24.18 
 
 
283 aa  46.2  0.0006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4711  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  22.46 
 
 
306 aa  46.2  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.728749  normal  0.431791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13130  carbon monoxide dehydrogenase, medium subunit  27.96 
 
 
284 aa  46.2  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1956  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  25 
 
 
295 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0844554 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2560  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  29.91 
 
 
303 aa  45.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.292441  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2949  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.99 
 
 
273 aa  44.3  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000190078 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0889  glyceraldehyde oxidoreductase medium chain  25.45 
 
 
271 aa  44.7  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4620  xanthine dehydrogenase small subunit  24.82 
 
 
493 aa  44.7  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.678377  normal  0.546493 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5684  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  28.34 
 
 
299 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0308299  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0415  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  20.36 
 
 
284 aa  44.3  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2960  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding  25.09 
 
 
265 aa  43.5  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.23003  hitchhiker  0.00916715 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2023  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding  23.62 
 
 
272 aa  43.1  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5969  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  23.55 
 
 
275 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.862592  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2836  molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding protein  28.48 
 
 
289 aa  43.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0853655  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1246  Hydantoinase B/oxoprolinase  25.76 
 
 
845 aa  43.1  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.446767  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3759  xanthine dehydrogenase small subunit  28.03 
 
 
467 aa  42.7  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2680  molybdopterin dehydrogenase FAD-binding protein  21.03 
 
 
290 aa  42.7  0.006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3000  xanthine dehydrogenase subunit XdhB  25.64 
 
 
292 aa  42.4  0.007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>