36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_2546 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009253  Dred_2546  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  324  3e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3337  rod shape-determining protein MreD  51.68 
 
 		 166 aa  149  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00122774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1464  hypothetical protein  46.58 
 
 		 164 aa  128  3e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1639  hypothetical protein  37.2 
 
 		 167 aa  105  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000014307  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1538  rod shape-determining protein MreD  45.67 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.207887  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4349  rod shape-determining protein MreD  31.71 
 
 		 169 aa  88.2  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.668781  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0539  hypothetical protein  29.53 
 
 		 169 aa  74.3  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.591389 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0090  hypothetical protein  32.34 
 
 		 176 aa  71.2  0.000000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14220  hypothetical protein  29.23 
 
 		 161 aa  64.3  0.0000000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000164387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2132  hypothetical protein  24.42 
 
 		 172 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00880614  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14220  rod shape-determining protein MreD  24.63 
 
 		 175 aa  57.8  0.00000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2561  rod shape-determining protein MreD  26.22 
 
 		 170 aa  53.1  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0143656  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1459  hypothetical protein  29.17 
 
 		 200 aa  52.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000164986  hitchhiker  0.0000261489 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1351  rod shape-determining protein MreD  38.96 
 
 		 172 aa  52.8  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0768  rod shape-determining protein MreD  38.89 
 
 		 167 aa  51.6  0.000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0581991  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1822  rod shape-determining protein MreD  29.82 
 
 		 173 aa  51.6  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1070  rod shape-determining protein MreD  34.38 
 
 		 180 aa  51.2  0.000006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1756  rod shape-determining protein MreD  25.18 
 
 		 160 aa  50.8  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2373  hypothetical protein  31.98 
 
 		 169 aa  49.7  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7280  hypothetical protein  38.82 
 
 		 176 aa  47.8  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.283498 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1732  rod shape-determining protein MreD  27.4 
 
 		 183 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.158456  normal  0.172881 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7283  rod shape-determining protein MreD  35.96 
 
 		 193 aa  47.4  0.00009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2080  rod shape-determining protein MreD, putative  31.19 
 
 		 161 aa  45.8  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2220  rod shape-determining protein MreD  45.16 
 
 		 166 aa  45.8  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2396  rod shape-determining protein MreD  26.85 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2108  rod shape-determining protein MreD  26.85 
 
 		 165 aa  45.8  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1804  signal transduction histidine kinase, LytS  35.38 
 
 		 163 aa  45.8  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2546  rod shape-determining protein MreD, putative  32.97 
 
 		 164 aa  45.1  0.0004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.500599  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5267  putative rod shape-determining protein MreD; putative membrane protein  44.64 
 
 		 178 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1316  hypothetical protein  29.9 
 
 		 161 aa  44.7  0.0006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.54085  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2461  hypothetical protein  25.93 
 
 		 160 aa  43.9  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0927  rod shape-determining protein MreD, putative  27.01 
 
 		 161 aa  43.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.387275  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1541  rod shape-determining protein MreD  29.33 
 
 		 193 aa  42.7  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.110151  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2859  hypothetical protein  25 
 
 		 162 aa  42.4  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0737242  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1414  rod shape-determining protein MreD  28.92 
 
 		 171 aa  41.2  0.006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0750  rod shape-determining protein MreD  36.05 
 
 		 171 aa  41.2  0.007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.276386  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>