131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2284 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU1193  ketose-bisphosphate aldolase family protein  74.53 
 
 
428 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0742776  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2383  fructose-bisphosphate aldolase  72.17 
 
 
427 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000563565  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3305  ketose-bisphosphate aldolase family protein  72.88 
 
 
426 aa  644    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0149261  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3299  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  74.88 
 
 
427 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000284986  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2284  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  100 
 
 
429 aa  884    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3253  ketose-bisphosphate aldolase class-II  71.56 
 
 
427 aa  630  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1007  fructose/tagatose bisphosphate aldolase-like protein  71.33 
 
 
427 aa  626  1e-178  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000202403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2461  ketose-bisphosphate aldolase family protein  70.95 
 
 
419 aa  603  1.0000000000000001e-171  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0218  ketose-bisphosphate aldolase class-II  40.85 
 
 
421 aa  261  2e-68  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1245  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  29.24 
 
 
364 aa  106  6e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1969  fructose-bisphosphate aldolase  29.68 
 
 
379 aa  103  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1611  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  31.37 
 
 
379 aa  99  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.455667  normal  0.226673 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1761  fructose-bisphosphate aldolase  31.05 
 
 
361 aa  97.1  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165684  normal  0.0733362 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0749  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  32.02 
 
 
287 aa  80.9  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000198166  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2168  fructose-bisphosphate aldolase  27.02 
 
 
298 aa  63.9  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00424601  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0127  fructose-bisphosphate aldolase  28.52 
 
 
293 aa  63.2  0.000000009  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000349017  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3436  tagatose-bisphosphate aldolase  26.52 
 
 
286 aa  62  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1876  fructose-bisphosphate aldolase  28.57 
 
 
293 aa  61.2  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000750549  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3578  tagatose-bisphosphate aldolase  26.47 
 
 
292 aa  61.2  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.88183  normal  0.360097 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2532  fructose-bisphosphate aldolase  27.95 
 
 
281 aa  60.5  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.08395e-19 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0305  fructose-bisphosphate aldolase  26.75 
 
 
281 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2337  fructose-bisphosphate aldolase  27.51 
 
 
281 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825474  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1641  tagatose-bisphosphate aldolase  23.76 
 
 
281 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2516  fructose-bisphosphate aldolase  27.51 
 
 
281 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.873005  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2161  fructose-bisphosphate aldolase  30.08 
 
 
286 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2199  fructose-bisphosphate aldolase  30.08 
 
 
286 aa  58.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03004  tagatose 6-phosphate aldolase 1, kbaY subunit  26.14 
 
 
286 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0568  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  26.14 
 
 
286 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.870343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1732  fructose-bisphosphate aldolase  30.71 
 
 
286 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.321158  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2300  fructose-bisphosphate aldolase  27.51 
 
 
281 aa  58.2  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2393  tagatose-bisphosphate aldolase  24.61 
 
 
292 aa  58.2  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3329  tagatose-bisphosphate aldolase  26.14 
 
 
286 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3619  tagatose-bisphosphate aldolase  26.14 
 
 
286 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02955  hypothetical protein  26.14 
 
 
286 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0561  tagatose-bisphosphate aldolase  26.14 
 
 
286 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.966652  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4454  tagatose-bisphosphate aldolase  26.14 
 
 
286 aa  58.2  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.389752  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0081  fructose-bisphosphate aldolase  25.11 
 
 
281 aa  57.8  0.0000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3364  tagatose-bisphosphate aldolase  30 
 
 
284 aa  57.8  0.0000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.884251 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1906  tagatose-bisphosphate aldolase  24.44 
 
 
281 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.957207  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2256  fructose-bisphosphate aldolase  27.07 
 
 
281 aa  57.4  0.0000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0136  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.29 
 
 
297 aa  57.4  0.0000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0929  tagatose-bisphosphate aldolase  30 
 
 
284 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0982  tagatose-bisphosphate aldolase  30 
 
 
284 aa  57  0.0000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl644  fructose-biphosphate aldolase  27.13 
 
 
296 aa  56.6  0.0000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3383  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  26.67 
 
 
283 aa  56.6  0.0000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235658  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1070  ketose-bisphosphate aldolase  27.91 
 
 
283 aa  55.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2358  ketose-bisphosphate aldolase  30.29 
 
 
278 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0595665 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0349  fructose-bisphosphate aldolase  24.74 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000191041  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3683  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.63 
 
 
288 aa  55.5  0.000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000328122  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0949  fructose-bisphosphate aldolase  25.77 
 
 
325 aa  55.1  0.000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0554404  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1045  fructose-bisphosphate aldolase  23.53 
 
 
324 aa  55.5  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468946  unclonable  0.00000168547 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  22.73 
 
 
309 aa  55.1  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.643061  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5458  fructose-bisphosphate aldolase  30.57 
 
 
285 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000373957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5494  fructose-bisphosphate aldolase  30.57 
 
 
285 aa  54.7  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000530479  unclonable  5.22733e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5465  fructose-bisphosphate aldolase  31.68 
 
 
285 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000314411  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5184  fructose-bisphosphate aldolase  31.68 
 
 
285 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000143751  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5019  fructose-bisphosphate aldolase  31.68 
 
 
285 aa  54.3  0.000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.84183e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5580  fructose-bisphosphate aldolase  31.68 
 
 
285 aa  54.3  0.000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000364685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3856  fructose-bisphosphate aldolase  30.39 
 
 
285 aa  54.3  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000214667  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5513  fructose-bisphosphate aldolase  31.68 
 
 
285 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000338483  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5428  fructose-bisphosphate aldolase  31.68 
 
 
285 aa  54.3  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2546599999999999e-35 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1329  fructose-bisphosphate aldolase  22.59 
 
 
324 aa  53.5  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569053  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4019  ketose-bisphosphate aldolase  29.79 
 
 
283 aa  53.5  0.000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5133  fructose-bisphosphate aldolase  31.68 
 
 
285 aa  53.5  0.000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000244747  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3443  fructose-bisphosphate aldolase  26.46 
 
 
287 aa  53.1  0.000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5035  fructose-bisphosphate aldolase  31.06 
 
 
285 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1557  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.93 
 
 
288 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.669513  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1350  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  25.93 
 
 
288 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.626031  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0396  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  27.56 
 
 
290 aa  52.8  0.00001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1325  fructose-bisphosphate aldolase  22.4 
 
 
374 aa  52.4  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3514  tagatose-bisphosphate aldolase  24.44 
 
 
330 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.542304  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3551  tagatose-bisphosphate aldolase  24.44 
 
 
330 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.207369  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3443  tagatose-bisphosphate aldolase  24.44 
 
 
330 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3611  tagatose-bisphosphate aldolase  24.44 
 
 
330 aa  52  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.089723  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3333  fructose-bisphosphate aldolase  26.07 
 
 
287 aa  52  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2390  ketose-bisphosphate aldolase  25.85 
 
 
278 aa  52.4  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0728  fructose-bisphosphate aldolase  21.77 
 
 
324 aa  51.6  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0035  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  24.23 
 
 
328 aa  51.2  0.00003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2822  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  23.89 
 
 
320 aa  50.8  0.00004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000185169  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3445  tagatose-bisphosphate aldolase  23.96 
 
 
284 aa  50.8  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000433037  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1398  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.14 
 
 
307 aa  50.1  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.635947  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2253  fructose-bisphosphate aldolase  25.4 
 
 
327 aa  50.1  0.00008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  21.52 
 
 
324 aa  50.1  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2255  ketose-bisphosphate aldolase  29.72 
 
 
280 aa  50.1  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000023078 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2579  tagatose-bisphosphate aldolase  27.18 
 
 
284 aa  49.7  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02024  D-tagatose 1,6-bisphosphate aldolase 2, catalytic subunit  28.78 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1561  class II aldolase, tagatose bisphosphate family  28.78 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00268792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2411  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  23.44 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0613985  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1712  fructose-bisphosphate aldolase  24.07 
 
 
279 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3176  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.56 
 
 
284 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00142497  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2232  tagatose-bisphosphate aldolase  28.78 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.524961  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1551  tagatose-bisphosphate aldolase  28.78 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0968  tagatose-bisphosphate aldolase  28.78 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.504675 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01988  hypothetical protein  28.78 
 
 
284 aa  48.5  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3250  hypothetical protein  27.27 
 
 
316 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1142  tagatose-bisphosphate aldolase  28.29 
 
 
284 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0660554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3636  tagatose-bisphosphate aldolase  25.84 
 
 
284 aa  48.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00921436  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1253  fructose-bisphosphate aldolase  23.05 
 
 
324 aa  48.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.750489  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3075  tagatose-bisphosphate aldolase  28.29 
 
 
284 aa  48.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000643002 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2873  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class II  27.62 
 
 
307 aa  47.8  0.0004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>