More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_2083 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_2083  acyl carrier protein  100 
 
 		 76 aa  142  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000417197  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1439  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 77 aa  92.4  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2747  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2839  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2931  acyl carrier protein  60.81 
 
 		 79 aa  90.5  7e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1604  acyl carrier protein  59.46 
 
 		 77 aa  89.7  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.0000908014  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4505  acyl carrier protein  58.11 
 
 		 81 aa  89  2e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.265662  normal  0.768311 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0168  acyl carrier protein  56 
 
 		 76 aa  87.8  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122767  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1852  acyl carrier protein  49.33 
 
 		 76 aa  87  7e-17  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2564  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 77 aa  85.5  2e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4504  acyl carrier protein  57.75 
 
 		 81 aa  85.5  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2430  acyl carrier protein  50.67 
 
 		 76 aa  85.5  2e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000000123335  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2325  acyl carrier protein  53.33 
 
 		 79 aa  85.9  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.596605  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1232  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 79 aa  85.5  2e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000152652  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1602  acyl carrier protein  55.41 
 
 		 77 aa  85.1  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000714682  normal  0.960802 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0660  acyl carrier protein  54.93 
 
 		 81 aa  85.1  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.179037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1392  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0959  acyl carrier protein  57.33 
 
 		 80 aa  84.7  4e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1606  acyl carrier protein  54.17 
 
 		 110 aa  84.7  4e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  8.57537e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2736  acyl carrier protein  56.76 
 
 		 80 aa  84.7  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0536  acyl carrier protein  58.97 
 
 		 80 aa  84.7  4e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.75126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1878  acyl carrier protein  55.41 
 
 		 77 aa  84.7  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0843624  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1420  acyl carrier protein  56 
 
 		 79 aa  84.7  4e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.704183 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1973  acyl carrier protein  59.72 
 
 		 77 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1979  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000485272  decreased coverage  0.000456446 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0170  acyl carrier protein  57.75 
 
 		 80 aa  83.6  8e-16  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.519616  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3407  acyl carrier protein  56.16 
 
 		 79 aa  83.6  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1624  acyl carrier protein  57.75 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000729948  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1630  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000123369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5387  acyl carrier protein  54.29 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1588  acyl carrier protein  57.75 
 
 		 78 aa  83.6  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000112562  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2789  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2805  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3105  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000128081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1157  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 77 aa  83.6  9e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.917954 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0533  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1082  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2904  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4236  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.223636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1720  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0831  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1004  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.486697  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1075  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.777412  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2909  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0644  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2850  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.814249  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1000  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2476  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1124  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1799  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.714333  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2180  acyl carrier protein  57.14 
 
 		 79 aa  83.6  9e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.253205  normal  0.154334 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2775  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3099  acyl carrier protein  48 
 
 		 76 aa  82.8  0.000000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0179771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0663  acyl carrier protein  54.67 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00175647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1185  acyl carrier protein  55.41 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  hitchhiker  0.00688444  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2262  acyl carrier protein  52 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.033873  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0401  acyl carrier protein  55.41 
 
 		 79 aa  83.2  0.000000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00338401  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2689  acyl carrier protein  55.41 
 
 		 82 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1717  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000515668  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1610  Acyl carrier protein (ACP)  53.33 
 
 		 90 aa  82.8  0.000000000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1720  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000138911  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002997  acyl carrier protein  54.17 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000114141  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02907  acyl carrier protein  54.17 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2427  acyl carrier protein  52 
 
 		 79 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.954024  normal  0.837243 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2395  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000802043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2465  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000179854  hitchhiker  0.00129052 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1583  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000266609  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20601  acyl carrier protein  55.41 
 
 		 80 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.417158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1760  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000614435  normal  0.41842 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2572  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 77 aa  83.2  0.000000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000656295  hitchhiker  0.00274043 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1836  acyl carrier protein  54.17 
 
 		 76 aa  83.2  0.000000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000576824  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01090  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000166866  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2553  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000526358  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1604  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 77 aa  82.8  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000038664  decreased coverage  0.000139314 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2507  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000000996587  hitchhiker  0.000000169384 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1310  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000174722  decreased coverage  4.37915e-18 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1215  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000103813  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1648  acyl carrier protein  54.05 
 
 		 80 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00355954  normal  0.46932 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1216  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.59624e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1295  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000656136  decreased coverage  3.5580799999999995e-20 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0126  acyl carrier protein  57.75 
 
 		 80 aa  82.8  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.395264  hitchhiker  0.00283985 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2230  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.78439e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1990  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.0000000000000274294  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1473  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000839248  hitchhiker  0.00000000000000262365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10300  acyl carrier protein  59.15 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00141848  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1527  acyl carrier protein  53.42 
 
 		 79 aa  82.4  0.000000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1266  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000000383773  normal  0.0632427 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01098  hypothetical protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000144532  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2173  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000401427  hitchhiker  0.000000000000202194 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2033  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 78 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000123338  hitchhiker  0.00000256014 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1722  acyl carrier protein  60 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000662355  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1745  acyl carrier protein  57.53 
 
 		 77 aa  82.4  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000920991  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1082  acyl carrier protein  56.94 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.325179  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2298  acyl carrier protein  52.7 
 
 		 77 aa  81.6  0.000000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00108603  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1672  acyl carrier protein  52 
 
 		 77 aa  82  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1629  acyl carrier protein  51.35 
 
 		 78 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2519  acyl carrier protein  57.75 
 
 		 79 aa  82  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1687  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000299329  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1579  acyl carrier protein  55.56 
 
 		 78 aa  81.3  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  2.86341e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2071  acyl carrier protein  59.15 
 
 		 74 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000431599  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>