23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_0189 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_0189  MerR family transcriptional regulator  100 
 
 		 251 aa  511  1e-144  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000528069  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0186  MerR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 250 aa  168  7e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0070729  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1566  MerR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000201032  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1311  MerR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1444  transcriptional regulator, MerR family  27.16 
 
 		 243 aa  56.2  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0102884  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3542  transcriptional regulator, MerR family  43.1 
 
 		 152 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.387014 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1547  MerR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 242 aa  50.8  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  37.5 
 
 		 269 aa  49.3  0.00005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3216  transcriptional regulator, MerR family  42.11 
 
 		 155 aa  49.3  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  28.47 
 
 		 248 aa  48.5  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  29.58 
 
 		 256 aa  47  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 297 aa  45.4  0.0008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  45.83 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3347  transcription regulator protein  34.62 
 
 		 159 aa  45.1  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.445877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  33.75 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1790  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 141 aa  43.9  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.269282  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0437  MerR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 161 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0543  transcriptional regulator, MerR family  32.89 
 
 		 252 aa  43.9  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1600  TetR family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 288 aa  42.7  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3230  transcriptional regulator, MerR family  28.57 
 
 		 249 aa  42.7  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.129557  normal  0.789887 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  27.45 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  24.69 
 
 		 272 aa  42  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0266  transcriptional regulator, MerR family  36.92 
 
 		 161 aa  42  0.009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00988584 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>