45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_180 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_180  integral membrane colicin V production protein  100 
 
 		 162 aa  310  3.9999999999999997e-84  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00284357  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0161  colicin V production protein  93.83 
 
 		 162 aa  296  1e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.781375  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0192  cvpA family protein  92.59 
 
 		 162 aa  290  6e-78  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1872  colicin V production protein  28.76 
 
 		 159 aa  69.7  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.356571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3077  Colicin V production protein  27.45 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.770622 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0510  Colicin V production protein  26.99 
 
 		 190 aa  65.9  0.0000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.103168  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2194  Colicin V production protein  28.66 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0552  Colicin V production protein  29.03 
 
 		 162 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2211  Colicin V production protein  35.33 
 
 		 171 aa  60.5  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0356  Colicin V production protein  31.25 
 
 		 169 aa  59.3  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2566  colicin V production protein  34.72 
 
 		 170 aa  58.2  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.491308  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2454  colicin V production family protein  26.8 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0223  CvpA family protein  32.73 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.903437  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2681  CvpA family protein  30.15 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1558  cvpA family protein  30.11 
 
 		 190 aa  52  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.383217  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1644  CvpA family protein  32.46 
 
 		 218 aa  51.6  0.000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0486  conserved hypothetical integral membrane protein, CvpA family  29.09 
 
 		 189 aa  51.2  0.000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0393  colicin V production protein  33.96 
 
 		 178 aa  50.4  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0780  colicin V production protein  28.3 
 
 		 173 aa  50.1  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3091  CvpA family protein  33.94 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05660  Colicin V production protein  27.1 
 
 		 163 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0448  cvpA family protein  29.03 
 
 		 187 aa  49.3  0.00002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.179388  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0823  hypothetical protein  27.38 
 
 		 178 aa  49.3  0.00002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0771  colicin V production protein  29.69 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0422  cvpA family protein  29.03 
 
 		 187 aa  48.1  0.00005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00865734  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0935  colicin V production protein  33.02 
 
 		 183 aa  48.1  0.00005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1015  Colicin V production protein  32.95 
 
 		 161 aa  47.4  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.280554  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1102  colicin V production protein  28.83 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.374563 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0917  colicin V production protein  25.86 
 
 		 166 aa  46.6  0.0002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1283  colicin V production protein  28.22 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.797864  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1298  hypothetical protein  26.83 
 
 		 177 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1297  hypothetical protein  26.83 
 
 		 177 aa  44.7  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1608  colicin V production protein  25.64 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4049  colicin V production protein  33.96 
 
 		 169 aa  43.9  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.868969  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1966  colicin V production protein  25.64 
 
 		 166 aa  43.5  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.530952 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1655  colicin V production protein  23.12 
 
 		 162 aa  43.1  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00513231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0061  colicin V production protein  27.78 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.822074 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3799  colicin V production protein  27.1 
 
 		 160 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1329  Colicin V production protein  28.81 
 
 		 192 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0804105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0524  bacteriocin production protein  26.09 
 
 		 163 aa  41.6  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00361211  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2981  colicin V production protein  21.88 
 
 		 162 aa  41.6  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259461  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1266  colicin V production protein  28 
 
 		 198 aa  41.6  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.488094  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2461  colicin V production protein  28.42 
 
 		 165 aa  40.8  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.400499  normal  0.228634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4358  Colicin V production protein  25.17 
 
 		 225 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1977  colicin V production transmembrane protein  28 
 
 		 165 aa  40.4  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.16947 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>