21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_1115 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_1115  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  253  9e-67  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1333  hypothetical protein  91.27 
 
 		 126 aa  228  2e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1144  hypothetical protein  82.54 
 
 		 126 aa  207  5e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  41.67 
 
 		 425 aa  55.8  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0696  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  38.98 
 
 		 500 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_751  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0185287  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0847  hypothetical protein  40.32 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000202964  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0766  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  40.32 
 
 		 96 aa  48.9  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.328817  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  30.7 
 
 		 438 aa  47.4  0.00007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  35.94 
 
 		 125 aa  46.2  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  30.34 
 
 		 455 aa  46.6  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0083  hypothetical protein  30 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  32.29 
 
 		 154 aa  44.7  0.0005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1122  hypothetical protein  28.26 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00301074 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  33.87 
 
 		 430 aa  43.1  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  30.49 
 
 		 423 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  27.63 
 
 		 433 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  35.06 
 
 		 488 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  35.38 
 
 		 443 aa  41.2  0.005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  27.68 
 
 		 468 aa  40.4  0.008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>