36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1333 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1333  hypothetical protein  100 
 
 		 126 aa  246  6e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1115  hypothetical protein  91.27 
 
 		 126 aa  228  2e-59  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1144  hypothetical protein  82.54 
 
 		 126 aa  206  9e-53  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  45 
 
 		 425 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0696  protein of unknown function DUF107  34.38 
 
 		 105 aa  50.8  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  33.71 
 
 		 455 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0083  hypothetical protein  35 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_751  hypothetical protein  40.32 
 
 		 96 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0185287  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  32.46 
 
 		 438 aa  48.5  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  32.94 
 
 		 423 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1786  hypothetical protein  41.67 
 
 		 500 aa  48.1  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0766  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  38.71 
 
 		 96 aa  47.4  0.00006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.328817  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0847  hypothetical protein  38.71 
 
 		 96 aa  47.8  0.00006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000202964  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  32.93 
 
 		 433 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2190  hypothetical protein  30.36 
 
 		 468 aa  45.1  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  37.1 
 
 		 430 aa  45.1  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0819  protein of unknown function DUF107  34.29 
 
 		 462 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.273876  normal  0.314261 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1122  hypothetical protein  29.35 
 
 		 123 aa  44.7  0.0005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00301074 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1704  nucleolar GTP-binding 1  32.29 
 
 		 154 aa  43.5  0.0009  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  30.49 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  29.9 
 
 		 464 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1783  hypothetical protein  36.92 
 
 		 490 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0749  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 		 464 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.482474 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0946  hypothetical protein  27.66 
 
 		 463 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0248108  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1989  nodulation efficiency protein NfeD  32.76 
 
 		 473 aa  41.6  0.004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00554582  normal  0.0711803 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2106  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 		 510 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.420737 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  35.38 
 
 		 443 aa  40.8  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0505  protein of unknown function DUF107  28.12 
 
 		 147 aa  40.8  0.006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2074  hypothetical protein  33.9 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  36.21 
 
 		 464 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3369  hypothetical protein  43.86 
 
 		 488 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1927  hypothetical protein  33.9 
 
 		 142 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  41.27 
 
 		 437 aa  40.4  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2105  hypothetical protein  33.9 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1889  hypothetical protein  33.9 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4519  hypothetical protein  33.88 
 
 		 452 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.829865  normal  0.308497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>