27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0766 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0766  membrane-bound serine protease (ClpP class)-like protein  100 
 
 
96 aa  189  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.328817  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0847  hypothetical protein  94.79 
 
 
96 aa  160  7e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000202964  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_751  hypothetical protein  92.71 
 
 
96 aa  156  8e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0185287  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0941  protein of unknown function DUF107  48.35 
 
 
425 aa  82.8  0.000000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0619  hypothetical protein  44.83 
 
 
443 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.857657  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2431  hypothetical protein  36.26 
 
 
433 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.25642  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1013  protein of unknown function DUF107  36.46 
 
 
455 aa  53.9  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0696  protein of unknown function DUF107  42.19 
 
 
105 aa  51.6  0.000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1115  hypothetical protein  40.32 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1333  hypothetical protein  35.23 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3060  protein of unknown function DUF107  30.77 
 
 
430 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2529  nodulation efficiency protein NfeD  34.78 
 
 
438 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.942851  normal  0.950756 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2913  hypothetical protein  28.89 
 
 
423 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1213  protein of unknown function DUF107  31.87 
 
 
439 aa  47  0.00008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00310663  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1623  hypothetical protein  34.04 
 
 
464 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.475533 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1336  hypothetical protein  38.81 
 
 
464 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.965224  normal  0.73412 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2190  hypothetical protein  35.23 
 
 
153 aa  43.9  0.0008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00820926  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1144  hypothetical protein  35.48 
 
 
126 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1354  protein of unknown function DUF107  35.05 
 
 
429 aa  43.5  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000001209  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0916  hypothetical protein  30.3 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0813  nodulation efficiency protein NfeD  31.87 
 
 
446 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000363847  hitchhiker  0.000000223757 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0766  protein of unknown function DUF107  39.34 
 
 
423 aa  42.7  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2767  nodulation efficiency protein NfeD  32.56 
 
 
464 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0017  protein of unknown function DUF107  33.33 
 
 
437 aa  42.7  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2223  hypothetical protein  39.66 
 
 
214 aa  42  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1025  protein of unknown function DUF107  28.92 
 
 
453 aa  40.8  0.006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1335  hypothetical protein  28.57 
 
 
154 aa  40  0.009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>