29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4045 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4045  protein of unknown function YGGT  100 
 
 
95 aa  181  4.0000000000000006e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000118098  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3637  protein of unknown function YGGT  37.04 
 
 
94 aa  50.4  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.160206  normal  0.479955 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1411  protein of unknown function YGGT  39.47 
 
 
84 aa  50.8  0.000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000759704  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3054  protein of unknown function YGGT  43.55 
 
 
99 aa  49.3  0.00002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.649035  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2188  integral membrane protein  42.86 
 
 
193 aa  48.5  0.00003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.199645  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2214  hypothetical protein  42.86 
 
 
192 aa  48.1  0.00004  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000107485  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1165  protein of unknown function YGGT  36.26 
 
 
105 aa  47.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000835508  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1018  protein of unknown function YGGT  42.03 
 
 
85 aa  47.4  0.00007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0861  hypothetical protein  35.44 
 
 
88 aa  47.4  0.00007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00343102  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0866  YGGT family protein  31.46 
 
 
104 aa  47  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0415  protein of unknown function YGGT  31.03 
 
 
107 aa  47  0.00009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000337721  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0956  protein of unknown function YGGT  26.19 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00321355  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0615  hypothetical protein  35.53 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.8017800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1346  protein of unknown function YGGT  37.14 
 
 
91 aa  45.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000041237  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1696  protein of unknown function YGGT  28.12 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.471282  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0714  protein of unknown function YGGT  36.07 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.674624  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0149  protein of unknown function YGGT  30.68 
 
 
100 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.041214 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0598  protein of unknown function YGGT  25.58 
 
 
96 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000000192983  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1166  protein of unknown function YGGT  29.67 
 
 
105 aa  43.1  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000866748  hitchhiker  0.00575832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1362  protein of unknown function YGGT  37.68 
 
 
86 aa  43.5  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0438  protein of unknown function YGGT  29.89 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000112129 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0261  YGGT family protein  29.89 
 
 
92 aa  42.4  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.634053  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1242  ylmG protein  35.71 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000199997  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0477  hypothetical protein  39.34 
 
 
99 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4761  protein of unknown function YGGT  33.01 
 
 
106 aa  41.2  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.211635 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3999  ylmG protein  33.72 
 
 
87 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000449706  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1085  protein of unknown function YGGT  30.56 
 
 
87 aa  40.4  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000150484  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3655  protein of unknown function YGGT  34.72 
 
 
199 aa  40  0.01  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1433  hypothetical protein  36.05 
 
 
98 aa  40  0.01  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.116879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>