36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_3662 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_3662  dipicolinate synthase subunit A  100 
 
 
303 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.189177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1943  dipicolinate synthase subunit A  51.01 
 
 
300 aa  294  1e-78  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.388369  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1272  dipicolinate synthase subunit A  44.85 
 
 
304 aa  264  1e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00345659  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3168  dipicolinate synthase subunit A  46.49 
 
 
303 aa  263  3e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0344441  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0348  dipicolinic acid synthetase, A subunit  48.46 
 
 
298 aa  253  3e-66  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1064  dipicolinate synthase subunit A  48.3 
 
 
297 aa  253  4.0000000000000004e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.189136  hitchhiker  0.00191942 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0943  dipicolinate synthase subunit A  47.9 
 
 
310 aa  251  9.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1456  dipicolinate synthase subunit A  44.6 
 
 
292 aa  239  2.9999999999999997e-62  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.1375  normal  0.482837 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1446  dipicolinic acid synthetase, A subunit  41.79 
 
 
302 aa  220  3e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.527023  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08650  dipicolinate synthase subunit A  41.28 
 
 
321 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.866181  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1165  dipicolinate synthase subunit A  39.33 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00398415  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2058  dipicolinate synthase subunit A  39.26 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3625  dipicolinate synthase subunit A  36.82 
 
 
300 aa  210  2e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3901  dipicolinate synthase subunit A  36.43 
 
 
300 aa  206  3e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00675499  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1343  dipicolinate synthase subunit A  36.43 
 
 
300 aa  206  3e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.552593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3840  dipicolinate synthase subunit A  36.08 
 
 
300 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3562  dipicolinate synthase subunit A  35.74 
 
 
300 aa  204  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3814  dipicolinate synthase subunit A  35.74 
 
 
300 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.15193e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3654  dipicolinate synthase subunit A  35.74 
 
 
300 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3850  dipicolinate synthase subunit A  35.74 
 
 
300 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000115985  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3939  dipicolinate synthase subunit A  35.74 
 
 
300 aa  204  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.385927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3544  dipicolinate synthase subunit A  35.4 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2455  dipicolinate synthase subunit A  36.43 
 
 
300 aa  199  5e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00908156  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0420  dipicolinate synthase subunit A  36.04 
 
 
290 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1705  dipicolinate synthase subunit A  36.76 
 
 
291 aa  169  4e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00515237  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1249  dipicolinate synthase subunit A  32.07 
 
 
294 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.342925  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0978  dipicolinate synthase subunit A  32.75 
 
 
292 aa  158  9e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.953632  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6049  Shikimate/quinate 5-dehydrogenase  30.88 
 
 
296 aa  111  1.0000000000000001e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.289518  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1099  adenosylhomocysteinase  31.19 
 
 
419 aa  53.1  0.000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.613377  normal  0.211169 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3401  adenosylhomocysteinase  34.38 
 
 
406 aa  52.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1485  adenosylhomocysteinase  32.06 
 
 
417 aa  45.4  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0673  adenosylhomocysteinase  29.13 
 
 
418 aa  44.7  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3293  alcohol dehydrogenase  35.14 
 
 
352 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.566343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47440  putative 2-hydroxyacid dehydrogenase  28.28 
 
 
310 aa  44.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3259  Prephenate dehydrogenase  34.67 
 
 
286 aa  42.4  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0991  Prephenate dehydrogenase  34.67 
 
 
286 aa  42.4  0.01  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>