74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_2393 on replicon NC_008010
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008010  Dgeo_2393  uroporphyrinogen III synthase HEM4  100 
 
 		 277 aa  554  1e-157  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2288  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  37.5 
 
 		 291 aa  142  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130767  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3043  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  30.51 
 
 		 376 aa  87.4  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.178966  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  31.48 
 
 		 391 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.000567169  hitchhiker  0.00000562153 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2335  uroporphyrinogen III synthase HEM4  29.56 
 
 		 271 aa  84.3  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5922  Uroporphyrinogen-III synthase-like protein  28.52 
 
 		 389 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0915623  normal  0.0919141 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0793  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.3 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.649128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2410  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.2 
 
 		 390 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000187789  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2162  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.93 
 
 		 512 aa  68.2  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000123773  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1494  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.84 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.074261 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0840  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.52 
 
 		 381 aa  63.5  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000157223  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1124  uroporphyrin-III C-methyltransferase  27.88 
 
 		 491 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.219261  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2640  uroporphyrinogen-III synthase  25.57 
 
 		 264 aa  62.4  0.000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1252  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.56 
 
 		 505 aa  60.8  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1377  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.57 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.855752  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1258  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.02 
 
 		 508 aa  60.1  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.323904  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0263  uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25.17 
 
 		 526 aa  58.2  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.240357  normal  0.829698 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1707  uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.31 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.752477 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1775  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.2 
 
 		 369 aa  57.4  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.488954  normal  0.025641 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0380  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.12 
 
 		 380 aa  57  0.0000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00848915 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3871  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.51 
 
 		 362 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.323432  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0338  uroporphyrinogen-III synthase  29.84 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.224423  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6178  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  28.37 
 
 		 391 aa  54.7  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677803  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5697  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.64 
 
 		 527 aa  54.7  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0301  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  27.08 
 
 		 380 aa  53.5  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0354  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  29.73 
 
 		 372 aa  53.1  0.000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1125  uroporphyrinogen-III C-methyltransferase, uroporphyrinogen-III synthase  23.86 
 
 		 516 aa  53.5  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.325525 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4262  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.96 
 
 		 362 aa  52.4  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00233788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10522  uroporphyrin-III C-methyltransferase hemD  22.22 
 
 		 565 aa  52.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2558  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.2 
 
 		 506 aa  52.4  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0671  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.11 
 
 		 554 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0678  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.11 
 
 		 554 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0691  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  26.11 
 
 		 554 aa  52  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.212228 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2963  uroporphyrinogen III synthase HEM4  22.35 
 
 		 269 aa  52  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4578  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.44 
 
 		 516 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.767972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1346  uroporphyrin-III C-methyltransferase  25.46 
 
 		 511 aa  50.8  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.694338  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1109  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.91 
 
 		 284 aa  51.2  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0846  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.11 
 
 		 571 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.75971  normal  0.92956 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1341  Uroporphyrinogen-III synthase  23.83 
 
 		 266 aa  50.8  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0065  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.11 
 
 		 569 aa  50.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255039  normal  0.829091 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2012  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.49 
 
 		 242 aa  49.7  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1813  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.61 
 
 		 394 aa  49.7  0.00005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0320621  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0687  hypothetical protein  24.24 
 
 		 505 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.943133  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1526  uroporphyrinogen-III synthase  23.62 
 
 		 266 aa  49.3  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000060174  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1325  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.95 
 
 		 387 aa  48.5  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.112832  normal  0.21583 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0672  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.2 
 
 		 284 aa  48.1  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00947107 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4563  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.07 
 
 		 281 aa  48.1  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.20438  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2796  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  27.31 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0507836  decreased coverage  0.000543328 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10264  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.96 
 
 		 381 aa  47.8  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.122536 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2353  uroporphyrinogen-III synthase  27.01 
 
 		 265 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1015  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  24.44 
 
 		 577 aa  47.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.172682  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3474  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  22.37 
 
 		 517 aa  47.4  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.027722  normal  0.984084 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02870  uroporphyrinogen-III synthase /uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  25.56 
 
 		 516 aa  47  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.052713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4165  uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.1 
 
 		 280 aa  47  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2720  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  25.89 
 
 		 368 aa  47  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.210642 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3549  uroporphyrinogen III synthase HEM4  26.67 
 
 		 266 aa  45.8  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0253  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.95 
 
 		 382 aa  45.8  0.0008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.518626 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24390  uroporphyrinogen-III synthase  27.5 
 
 		 558 aa  45.8  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3505  Uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.7 
 
 		 377 aa  45.4  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0781681  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00840  uroporphyrinogen-III synthase  25.46 
 
 		 377 aa  45.1  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0880377  normal  0.206146 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1576  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.03 
 
 		 281 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5710  putative uroporphyrinogen-III synthase  22.76 
 
 		 277 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0928  uroporphyrinogen-III synthase  29.68 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.232267  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4438  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  22.86 
 
 		 526 aa  43.5  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3325  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  23.12 
 
 		 512 aa  43.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0487  uroporphyrinogen-III synthase / uroporphyrinogen-III C-methyltransferase  24.35 
 
 		 607 aa  43.1  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.188044  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0273  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.61 
 
 		 382 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.92823  normal  0.27348 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6129  uroporphyrinogen III synthase HEM4  24.38 
 
 		 604 aa  43.1  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.143048  normal  0.442264 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0263  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  25.61 
 
 		 382 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.169391  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1742  bifunctional uroporphyrinogen-III synthetase/response regulator domain protein  28.57 
 
 		 435 aa  43.1  0.005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.849504 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3201  uroporphyrin-III C-methyltransferase  26.67 
 
 		 519 aa  43.1  0.005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2579  Uroporphyrinogen-III synthase  26.49 
 
 		 266 aa  42.7  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1028  uroporphyrin-III C-methyltransferase  23.39 
 
 		 505 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0920  Uroporphyrin-III C/tetrapyrrole (Corrin/Porphyrin) methyltransferase  25.98 
 
 		 506 aa  42  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>