38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0561 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0561  major facilitator transporter  100 
 
 		 402 aa  747    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1835  major facilitator superfamily MFS_1  35.16 
 
 		 390 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.178489  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2304  major facilitator transporter  35.82 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1626  major facilitator superfamily MFS_1  30.9 
 
 		 395 aa  121  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0644  major facilitator transporter  30 
 
 		 397 aa  97.4  4e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.535291  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0605  hypothetical protein  24.5 
 
 		 397 aa  74.7  0.000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.184061  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1033  major facilitator transporter  21.37 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.177021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1014  major facilitator transporter  21.37 
 
 		 396 aa  61.2  0.00000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00148037  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0502  major facilitator transporter  25.07 
 
 		 387 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0674  major facilitator superfamily protein  25.63 
 
 		 394 aa  55.5  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.522408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0273  major facilitator transporter  22.47 
 
 		 405 aa  50.8  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.473201  normal  0.019317 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2342  major facilitator superfamily MFS_1  31.41 
 
 		 427 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000352958  decreased coverage  0.00223229 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2678  major facilitator superfamily MFS_1  31.53 
 
 		 408 aa  47  0.0005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2463  major facilitator superfamily MFS_1  33.6 
 
 		 438 aa  47  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.132377  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0928  multidrug resistance protein  28.77 
 
 		 400 aa  47  0.0006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0284  hypothetical protein  28.95 
 
 		 391 aa  46.6  0.0008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1916  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.16 
 
 		 478 aa  46.2  0.0009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0782092  hitchhiker  0.00395657 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0835  multidrug resistance protein  30.43 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0719819  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0795  multidrug resistance protein  30.43 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119292  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2378  major facilitator superfamily MFS_1  24.35 
 
 		 415 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0930  multidrug resistance protein  30.43 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.2108e-39 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0744  multidrug resistance protein B  30.43 
 
 		 400 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000697071  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3242  major facilitator superfamily MFS_1  26.36 
 
 		 401 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0911  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 		 410 aa  45.1  0.002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0999  multidrug resistance protein  28.99 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000493568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0890  multidrug resistance protein  29.71 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.742643  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4444  multidrug resistance protein  27.41 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.239413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0731  multidrug resistance protein B  28.99 
 
 		 400 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0747  major facilitator transporter  28.91 
 
 		 400 aa  44.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2242  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  30.68 
 
 		 430 aa  44.7  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.187977  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0603  major facilitator superfamily MFS_1  24.06 
 
 		 391 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000645746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0829  major facilitator transporter  25 
 
 		 426 aa  45.1  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.0000111783  unclonable  0.000000000756922 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3372  transporter, major facilitator family  22.49 
 
 		 396 aa  45.1  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1499  major facilitator transporter  26.16 
 
 		 416 aa  43.9  0.005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0588  major facilitator transporter  23.44 
 
 		 384 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0912003  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2645  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  33.14 
 
 		 420 aa  43.5  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3208  major facilitator transporter  38.64 
 
 		 415 aa  43.1  0.009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.54065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0094  major facilitator transporter  31.53 
 
 		 429 aa  43.1  0.009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000112737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>