117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0091 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_0091  hypothetical protein  100 
 
 		 114 aa  232  1.0000000000000001e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2556  hypothetical protein  78.89 
 
 		 105 aa  142  1e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.51201  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2555  hypothetical protein  70.97 
 
 		 112 aa  134  4e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18835  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0130  protein of unknown function DUF156  59.34 
 
 		 96 aa  95.5  2e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0295  hypothetical protein  57.29 
 
 		 94 aa  95.9  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0324  hypothetical protein  53.49 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.26803  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10985  hypothetical protein  46.43 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0616995  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2350  protein of unknown function DUF156  38.89 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0979589  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1674  hypothetical protein  38.36 
 
 		 97 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.184479  hitchhiker  0.000845863 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01250  hypothetical protein  32.69 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1688  protein of unknown function DUF156  35.29 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1700  protein of unknown function DUF156  35.29 
 
 		 103 aa  51.2  0.000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0139409  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0183  hypothetical protein  36.36 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.49313  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0279  YvgZ  36.36 
 
 		 103 aa  50.8  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1552  protein of unknown function DUF156  38.96 
 
 		 116 aa  50.4  0.000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.05294  normal  0.0149164 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2861  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  50.4  0.000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3691  hypothetical protein  36.78 
 
 		 135 aa  50.1  0.000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.32018  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4322  hypothetical protein  39.02 
 
 		 133 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0131  hypothetical protein  36.9 
 
 		 90 aa  49.7  0.00001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00000289357  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11230  hypothetical protein  35.35 
 
 		 103 aa  49.7  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.499044 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0333  protein of unknown function DUF156  36.78 
 
 		 97 aa  50.1  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.14085e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0207  hypothetical protein  34.09 
 
 		 91 aa  49.3  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3133  protein of unknown function DUF156  42.86 
 
 		 99 aa  48.1  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.032258  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2133  hypothetical protein  35.44 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0961579  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4130  protein of unknown function DUF156  33.98 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0195  hypothetical protein  33.73 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.165888  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3516  hypothetical protein  38.1 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0391  hypothetical protein  35.9 
 
 		 95 aa  47  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  30.77 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3092  hypothetical protein  32.95 
 
 		 91 aa  46.2  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.642683  normal  0.388953 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0438  protein of unknown function DUF156  32.98 
 
 		 107 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1531  hypothetical protein  45.31 
 
 		 96 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0465  hypothetical protein  36.23 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0714  hypothetical protein  31.33 
 
 		 89 aa  45.4  0.0002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00303881  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3411  protein of unknown function DUF156  29.55 
 
 		 91 aa  46.2  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0125991 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3676  protein of unknown function DUF156  30.77 
 
 		 103 aa  45.4  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0410766  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0193  hypothetical protein  32.53 
 
 		 89 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00253275  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1802  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3781  hypothetical protein  30.23 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00152892  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3870  hypothetical protein  31.46 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.863177 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2124  hypothetical protein  30.43 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0114083  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2162  hypothetical protein  30.43 
 
 		 97 aa  44.3  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1421  hypothetical protein  31.25 
 
 		 96 aa  44.3  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0973225  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5055  hypothetical protein  31.65 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3498  hypothetical protein  30.23 
 
 		 100 aa  43.9  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.434736  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1475  hypothetical protein  26.14 
 
 		 88 aa  43.9  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000574434  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3200  hypothetical protein  31.65 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  35.05 
 
 		 99 aa  43.9  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3714  protein of unknown function DUF156  36.59 
 
 		 123 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.245735  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0617  hypothetical protein  31.25 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0538  hypothetical protein  31.25 
 
 		 96 aa  43.9  0.0008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0774012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1271  protein of unknown function DUF156  31.88 
 
 		 88 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.858801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1470  hypothetical protein  30.23 
 
 		 100 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0383615  hitchhiker  0.0000277305 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19810  hypothetical protein  38.82 
 
 		 119 aa  43.9  0.0008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.418046  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1694  hypothetical protein  30.11 
 
 		 97 aa  43.5  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.607073  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3761  hypothetical protein  30.23 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.894336  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3577  hypothetical protein  30.23 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000813292  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3477  hypothetical protein  30.23 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00168287  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3489  hypothetical protein  30.23 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0105501  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0892  hypothetical protein  31.11 
 
 		 92 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  2.86741e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3861  hypothetical protein  30.23 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00835588  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2278  hypothetical protein  39.62 
 
 		 92 aa  43.1  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0533  hypothetical protein  37.14 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0395944  normal  0.0381301 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0690  hypothetical protein  35.37 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3876  hypothetical protein  30.26 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000226345  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0819  hypothetical protein  32.43 
 
 		 89 aa  43.5  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.0000000405513  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5165  hypothetical protein  31.13 
 
 		 102 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3831  hypothetical protein  30.23 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.715708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3743  hypothetical protein  30.23 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000430591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10580  hypothetical protein  38.55 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.0042499  normal  0.482533 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1807  protein of unknown function DUF156  35 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2077  protein of unknown function DUF156  35.37 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.938076  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2969  hypothetical protein  32.08 
 
 		 95 aa  42.4  0.002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0817169 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0910  hypothetical protein  29.55 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1481  hypothetical protein  30.34 
 
 		 91 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.494418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0445  hypothetical protein  37.14 
 
 		 103 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.467567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3243  hypothetical protein  27.84 
 
 		 129 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3942  hypothetical protein  34.15 
 
 		 91 aa  42  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06025  hypothetical protein  28.75 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1857  protein of unknown function DUF156  30.34 
 
 		 91 aa  42.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.151072  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3728  protein of unknown function DUF156  29.27 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00718584  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1552  protein of unknown function DUF156  31.71 
 
 		 90 aa  42  0.003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3495  hypothetical protein  31.31 
 
 		 121 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2242  hypothetical protein  30.19 
 
 		 97 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00107206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0446  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00705358 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2241  transcriptional repressor RcnR  31.71 
 
 		 90 aa  42  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2393  transcriptional repressor RcnR  31.71 
 
 		 90 aa  42  0.003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1542  hypothetical protein  31.71 
 
 		 90 aa  42  0.003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0938  transcriptional repressor RcnR  31.71 
 
 		 90 aa  42  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.539838  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1133  transcriptional repressor RcnR  31.71 
 
 		 90 aa  42  0.003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3088  transcriptional repressor RcnR  31.71 
 
 		 90 aa  42  0.003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.203415 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0435  protein of unknown function DUF156  33.33 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3652  protein of unknown function DUF156  32.32 
 
 		 121 aa  42  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13320  hypothetical protein  34.12 
 
 		 91 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00119769  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2051  protein of unknown function DUF156  41.27 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  7.44014e-26 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0391  hypothetical protein  32.5 
 
 		 91 aa  41.2  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2491  hypothetical protein  30.11 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.00258271  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2141  hypothetical protein  26.79 
 
 		 110 aa  41.2  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.52001  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0109  regulator protein FrmR  30.95 
 
 		 91 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3585  protein of unknown function DUF156  28.41 
 
 		 92 aa  41.2  0.004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000231569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>