200 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0109 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0109  regulator protein FrmR  100 
 
 		 91 aa  186  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00311  regulator protein that represses frmRAB operon  59.34 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3249  protein of unknown function DUF156  59.34 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00315  hypothetical protein  59.34 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0388  regulator protein FrmR  59.34 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.183191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3268  regulator protein FrmR  59.34 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0422  regulator protein FrmR  59.34 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0382  regulator protein FrmR  59.34 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0272  regulator protein FrmR  59.34 
 
 		 91 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0131  hypothetical protein  58.51 
 
 		 94 aa  110  6e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0145  hypothetical protein  60.87 
 
 		 89 aa  110  6e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.192662  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3388  protein of unknown function DUF156  54.95 
 
 		 91 aa  108  2.0000000000000002e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.467079 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0126  hypothetical protein  57.45 
 
 		 94 aa  108  2.0000000000000002e-23  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00761073  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5634  hypothetical protein  62.64 
 
 		 74 aa  108  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6312  regulator protein FrmR  63.74 
 
 		 91 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6017  regulator protein FrmR  63.74 
 
 		 91 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4527  hypothetical protein  51.65 
 
 		 91 aa  103  6e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118934  normal  0.237201 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1959  hypothetical protein  52.75 
 
 		 91 aa  101  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2231  hypothetical protein  50.55 
 
 		 91 aa  99.8  1e-20  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1529  putative cytoplasmic protein  51.65 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.434417  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1714  hypothetical protein  51.65 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.743684  normal  0.0184205 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1742  putative cytoplasmic protein  51.65 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224779  normal  0.281419 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1747  putative cytoplasmic protein  51.65 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.330539  normal  0.236334 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1806  hypothetical protein  51.65 
 
 		 91 aa  99  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0084  protein of unknown function DUF156  50 
 
 		 92 aa  98.2  3e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.702684  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1178  protein of unknown function DUF156  53.26 
 
 		 91 aa  97.8  4e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.541287  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47420  hypothetical protein  51.65 
 
 		 91 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.696075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4093  hypothetical protein  51.65 
 
 		 91 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.429515  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2799  hypothetical protein  49.45 
 
 		 88 aa  97.4  5e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.37392 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2289  protein of unknown function DUF156  49.45 
 
 		 88 aa  97.1  7e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4323  hypothetical protein  48.35 
 
 		 91 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.880219  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03926  hypothetical protein  49.45 
 
 		 90 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0812275 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0066  protein of unknown function DUF156  46.74 
 
 		 92 aa  92  3e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1127  hypothetical protein  44.57 
 
 		 92 aa  89.4  2e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.11233  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1089  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2846  protein containing  42.86 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.800541  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2693  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  88.6  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4424  hypothetical protein  50 
 
 		 81 aa  87.8  5e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.124641  normal  0.445474 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0049  hypothetical protein  41.76 
 
 		 91 aa  87.4  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0391  hypothetical protein  41.76 
 
 		 91 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3299  protein of unknown function DUF156  47.25 
 
 		 90 aa  86.7  1e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2130  hypothetical protein  45.65 
 
 		 92 aa  85.9  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0534961  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5280  hypothetical protein  41.76 
 
 		 91 aa  85.9  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5149  protein of unknown function DUF156  44.57 
 
 		 92 aa  85.1  3e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4111  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  85.1  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.9127 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4762  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0400703  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3405  hypothetical protein  42.86 
 
 		 91 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0569  protein of unknown function DUF156  46.81 
 
 		 92 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.478588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1584  protein of unknown function DUF156  45.74 
 
 		 92 aa  82  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.948708  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0465  hypothetical protein  40.66 
 
 		 90 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1678  protein of unknown function DUF156  44.57 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2938  protein of unknown function DUF156  44.57 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3942  hypothetical protein  39.56 
 
 		 91 aa  80.9  0.000000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2538  protein of unknown function DUF156  44.57 
 
 		 92 aa  80.9  0.000000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.840568  normal  0.458939 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5055  hypothetical protein  41.76 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.281346  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3200  hypothetical protein  41.76 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2350  protein of unknown function DUF156  42.86 
 
 		 90 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0979589  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2861  hypothetical protein  43.48 
 
 		 90 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.341142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3563  hypothetical protein  40 
 
 		 171 aa  77.4  0.00000000000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3474  hypothetical protein  41.57 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.320238  normal  0.0192949 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2855  hypothetical protein  39.56 
 
 		 91 aa  77  0.00000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.458053 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6501  protein of unknown function DUF156  41.3 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.832165  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2648  hypothetical protein  41.3 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2529  hypothetical protein  41.3 
 
 		 92 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3505  hypothetical protein  43.01 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.949542  normal  0.637535 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3352  hypothetical protein  39.56 
 
 		 90 aa  75.5  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3422  hypothetical protein  42.39 
 
 		 92 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.51342  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1552  protein of unknown function DUF156  39.56 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1133  transcriptional repressor RcnR  39.56 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3088  transcriptional repressor RcnR  39.56 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.203415 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1340  hypothetical protein  42.47 
 
 		 94 aa  74.7  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.975436  normal  0.434678 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1542  hypothetical protein  39.56 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0938  transcriptional repressor RcnR  39.56 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.539838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2241  transcriptional repressor RcnR  39.56 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2393  transcriptional repressor RcnR  39.56 
 
 		 90 aa  74.7  0.0000000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3401  hypothetical protein  40.22 
 
 		 92 aa  74.3  0.0000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3586  hypothetical protein  38.46 
 
 		 91 aa  73.9  0.0000000000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1451  hypothetical protein  38.46 
 
 		 91 aa  73.6  0.0000000000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.521198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06025  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  73.2  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1505  hypothetical protein  38.2 
 
 		 91 aa  72.8  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.258282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02794  hypothetical protein  38.71 
 
 		 90 aa  72  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3107  hypothetical protein  40.66 
 
 		 90 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3646  hypothetical protein  40.22 
 
 		 94 aa  71.6  0.000000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.298498  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0296  hypothetical protein  42.31 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.311118 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3357  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3176  YohL  38.46 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3255  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0285545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3241  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.0114048 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3192  YohL  38.46 
 
 		 90 aa  70.9  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0966  hypothetical protein  34.07 
 
 		 91 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.52131  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3836  hypothetical protein  39.56 
 
 		 90 aa  68.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.663904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1793  hypothetical protein  35.16 
 
 		 90 aa  67.8  0.00000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.270253  hitchhiker  0.00292517 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0853  protein of unknown function DUF156  36.26 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.509806 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0976  protein of unknown function DUF156  36.26 
 
 		 90 aa  67  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.805178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0756  hypothetical protein  38.46 
 
 		 90 aa  65.9  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5162  hypothetical protein  32.58 
 
 		 91 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7457  hypothetical protein  38.67 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2658  protein of unknown function DUF156  32.18 
 
 		 99 aa  56.2  0.0000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00269509  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1624  protein of unknown function DUF156  31.87 
 
 		 89 aa  55.8  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00315628  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1112  protein of unknown function DUF156  31.4 
 
 		 98 aa  56.2  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.192751  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>