28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4739 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_4739  vanadium-dependent haloperoxidase family protein  100 
 
 
434 aa  910    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.406685 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6726  hypothetical protein  46.87 
 
 
441 aa  417  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0771902  normal  0.314379 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3033  hypothetical protein  45.01 
 
 
440 aa  412  1e-114  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.715848 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5055  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  39.72 
 
 
451 aa  330  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.617643  normal  0.668307 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4735  phosphoesterase PA-phosphatase related  38.39 
 
 
452 aa  306  5.0000000000000004e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.829288 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5972  hypothetical protein  30.28 
 
 
471 aa  171  2e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.351131 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6085  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.48 
 
 
449 aa  150  5e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0927  phosphoesterase, PA-phosphatase related  29.43 
 
 
5216 aa  143  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4523  phosphoesterase PA-phosphatase related  34.73 
 
 
421 aa  138  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2325  phosphoesterase PA-phosphatase related  31.56 
 
 
426 aa  134  3e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809259 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1609  hypothetical protein  30.3 
 
 
433 aa  126  9e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2488  hypothetical protein  29.14 
 
 
493 aa  108  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000005814 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1749  phosphoesterase PA-phosphatase-like protein  26.43 
 
 
403 aa  97.4  5e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1698  phosphoesterase, PA-phosphatase related  23.88 
 
 
411 aa  96.3  9e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00849599  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2561  hypothetical protein  28.52 
 
 
480 aa  94  4e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490914  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1660  phosphoesterase, PA-phosphatase related  26.94 
 
 
407 aa  92.4  1e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5242  phosphoesterase PA-phosphatase related  28.9 
 
 
428 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1347  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.4 
 
 
513 aa  86.3  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0022  phosphoesterase PA-phosphatase related  25.18 
 
 
520 aa  84.7  0.000000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.135739 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3664  hemolysin-type calcium-binding region  21.47 
 
 
678 aa  70.9  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.157401  normal  0.209171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4663  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  26.23 
 
 
515 aa  71.2  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.626418  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1740  phosphoesterase PA-phosphatase related  24.58 
 
 
431 aa  64.7  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.867472  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05520  phosphoesterase PA-phosphatase related  26.4 
 
 
308 aa  63.5  0.000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000494508  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3504  chloride peroxidase  24.41 
 
 
598 aa  56.6  0.0000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2161  hypothetical protein  35.19 
 
 
870 aa  54.3  0.000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2900  hypothetical protein  26.17 
 
 
473 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4660  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  22.9 
 
 
502 aa  50.4  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.673229  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2995  hypothetical protein  31.25 
 
 
667 aa  48.9  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.617304  hitchhiker  0.00000029866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>