65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4153 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_4153  ribosomal protein L32  100 
 
 		 64 aa  131  3e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.365847 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5250  ribosomal protein L32  64.06 
 
 		 64 aa  87.4  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00622213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0206  50S ribosomal protein L32  61.02 
 
 		 64 aa  75.9  0.0000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02340  50S ribosomal protein L32 (Ribosomal protein I)  54.84 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0647  50S ribosomal protein L32  54.24 
 
 		 64 aa  67.4  0.00000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.24173  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0711  50S ribosomal protein L32  55.17 
 
 		 62 aa  65.9  0.0000000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.282817 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3815  ribosomal protein L32  54.24 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6298  ribosomal protein L32  50.79 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.507877 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0868  50S ribosomal protein L32  48.44 
 
 		 64 aa  52  0.000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1603  ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 65 aa  47.4  0.00008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0931242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1434  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 58 aa  46.2  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000740742  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1870  ribosomal protein L32  48.28 
 
 		 59 aa  47  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.819487  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02705  50S ribosomal protein L32  46.67 
 
 		 62 aa  47  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1941  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 61 aa  43.9  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000297405  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1712  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000329996  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1755  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.00000000534053  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2652  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000000778579  hitchhiker  0.0000333205 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1715  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.0000000000625062  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1808  ribosomal protein L32  43.86 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.253284  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0403  50S ribosomal protein L32  44.83 
 
 		 59 aa  43.5  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1578  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 56 aa  43.1  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000427195  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1113  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2129  ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0120071  normal  0.0237649 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1207  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 64 aa  42.4  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2780  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2430  ribosomal protein L32  44.07 
 
 		 59 aa  42.7  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0972633  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2562  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000144666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1626  50S ribosomal protein L32  46.55 
 
 		 60 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.904867  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2470  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000146933  hitchhiker  0.00550798 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2400  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 56 aa  42.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000318296  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1048  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 59 aa  42  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2498  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 56 aa  42  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000463288  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1077  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 59 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.990769 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0999  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 59 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.852349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2914  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 59 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.161302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4231  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 59 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0358913  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1070  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 59 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.793355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0639  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 59 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0492807  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0995  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 59 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1119  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 59 aa  42  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1611  50S ribosomal protein L32  45.61 
 
 		 56 aa  41.2  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000123515  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1597  50S ribosomal protein L32  37.29 
 
 		 60 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000469826  normal  0.427035 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2297  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 56 aa  41.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.000000000000139706  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1599  50S ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 56 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000342659  hitchhiker  0.00352794 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2185  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.409214  normal  0.0976531 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1599  50S ribosomal protein L32  37.93 
 
 		 60 aa  41.2  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.919739  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2467  ribosomal protein L32  37.93 
 
 		 61 aa  41.2  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000135728  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1715  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1495  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 56 aa  41.2  0.005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000237731  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1085  ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.444858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1984  50S ribosomal protein L32  40.35 
 
 		 56 aa  40.8  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709039  decreased coverage  0.000595562 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3599  ribosomal protein L32  36.84 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.590227  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0978  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0979958 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2794  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.317349  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0528  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2855  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1805  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2482  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.130811  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2909  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.180854  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2800  50S ribosomal protein L32  41.38 
 
 		 59 aa  40.8  0.007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.223415  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0396  50S ribosomal protein L32  43.1 
 
 		 59 aa  40.4  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1644  50S ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 60 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.119469  normal  0.262777 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1411  50S ribosomal protein L32P  37.93 
 
 		 60 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.361798  hitchhiker  0.00000964737 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3835  ribosomal protein L32  45.76 
 
 		 60 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.460634  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2038  ribosomal protein L32  42.11 
 
 		 56 aa  40  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000023625  normal  0.0132901 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>