21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_3341 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_3341  protein of unknown function DUF1486  100 
 
 
134 aa  279  1e-74  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188642  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5423  hypothetical protein  65.65 
 
 
134 aa  193  6e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3560  hypothetical protein  50.78 
 
 
131 aa  145  1.0000000000000001e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.549553  normal  0.183463 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2875  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  141  3e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.191047  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2128  hypothetical protein  53.97 
 
 
133 aa  141  3e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2281  hypothetical protein  50 
 
 
134 aa  140  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0629  hypothetical protein  50 
 
 
133 aa  140  5e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.91146  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0596  hypothetical protein  51.56 
 
 
132 aa  140  6e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03632  hypothetical protein  48.85 
 
 
139 aa  137  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3131  hypothetical protein  48.06 
 
 
135 aa  136  1e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.437849  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1042  hypothetical protein  48.06 
 
 
141 aa  134  3.0000000000000003e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.141033  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3272  hypothetical protein  49.24 
 
 
133 aa  133  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0933  hypothetical protein  48.48 
 
 
132 aa  133  9e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4457  hypothetical protein  48.48 
 
 
132 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00222547 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0894  hypothetical protein  47.73 
 
 
132 aa  131  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2926  hypothetical protein  50.79 
 
 
141 aa  131  3.9999999999999996e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0997  hypothetical protein  46.21 
 
 
132 aa  127  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.954295  hitchhiker  0.000000182894 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1820  hypothetical protein  46.46 
 
 
136 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.394206  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0997  hypothetical protein  39.06 
 
 
135 aa  106  9.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000000000466996  unclonable  8.0025e-19 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2218  hypothetical protein  25 
 
 
134 aa  67  0.00000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.190244  normal  0.341322 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2071  hypothetical protein  28.35 
 
 
138 aa  53.9  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.140777  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>