22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2444 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2444  hypothetical protein  100 
 
 		 498 aa  1025    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.139331  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1073  hypothetical protein  34.08 
 
 		 568 aa  251  3e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0889  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.96 
 
 		 403 aa  48.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.167597 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1033  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.96 
 
 		 403 aa  48.1  0.0004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.877554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4182  glucose/sorbosone dehydrogenase-like  24.91 
 
 		 379 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1660  L-sorbosone dehydrogenase, putative  23.79 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5608  putative L-sorbosone dehydrogenase protein  29.13 
 
 		 525 aa  45.4  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.759477  hitchhiker  0.00328711 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0336  hypothetical protein  29.13 
 
 		 502 aa  45.1  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2235  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  24.91 
 
 		 379 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2048  L-sorbosone dehydrogenase, putative  24.11 
 
 		 367 aa  44.7  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.228554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2860  L-sorbosone dehydrogenase  23.88 
 
 		 389 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597888  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2969  hypothetical protein  23.51 
 
 		 355 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2921  L-sorbosone dehydrogenase  23.51 
 
 		 372 aa  44.3  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1510  L-sorbosone dehydrogenase  24.72 
 
 		 384 aa  44.3  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.147388  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0920  L-sorbosone dehydrogenase  23.88 
 
 		 316 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2546  glucose/sorbosone dehydrogenases  23.51 
 
 		 299 aa  44.3  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.454169  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33480  L-sorbosone dehydrogenase  23.72 
 
 		 439 aa  44.3  0.005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.334174  normal  0.0461454 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0747  putative membrane-bound dehydrogenase oxidoreductase protein  22.95 
 
 		 377 aa  44.3  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4756  putative membrane-anchored oxidoreductase  24.73 
 
 		 514 aa  43.9  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.931311  normal  0.0309571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2845  L-sorbosone dehydrogenase  24.03 
 
 		 439 aa  43.9  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1949  putative L-sorbosone dehydrogenase  31.25 
 
 		 429 aa  43.9  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.220876  normal  0.0233065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0504  glucose sorbosone dehydrogenase  27.07 
 
 		 367 aa  43.9  0.007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>