16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3439 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3439  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  463  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2917  hypothetical protein  96.12 
 
 		 219 aa  413  1e-114  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00000650535  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2576  hypothetical protein  39.67 
 
 		 198 aa  139  3e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000123504  unclonable  0.0000129022 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3782  hypothetical protein  35.29 
 
 		 272 aa  60.8  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.756711 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0390.1  hypothetical protein  27.13 
 
 		 161 aa  58.5  0.00000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4260  hypothetical protein  34.78 
 
 		 239 aa  55.1  0.0000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2858  hypothetical protein  24.68 
 
 		 187 aa  50.4  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.30287 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3513  transposase  27.66 
 
 		 222 aa  50.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0280  hypothetical protein  27.59 
 
 		 360 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000851803  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0244  hypothetical protein  24.82 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.486639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2903  hypothetical protein  30.29 
 
 		 311 aa  48.9  0.00006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0384  hypothetical protein  29.59 
 
 		 216 aa  47.4  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1596  hypothetical protein  29 
 
 		 151 aa  42.7  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0754953  normal  0.630318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1254  transposase  29.55 
 
 		 208 aa  42.4  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1718  hypothetical protein  36.11 
 
 		 206 aa  42  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0376  transposase  32.58 
 
 		 202 aa  41.6  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.581845  hitchhiker  0.0000248645 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>