19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1747 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_1747  hypothetical protein  100 
 
 
257 aa  532  1e-150  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.785012  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0363  hypothetical protein  36.96 
 
 
250 aa  154  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000682853 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0520  hypothetical protein  31.97 
 
 
241 aa  131  9e-30  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2178  hypothetical protein  31.35 
 
 
274 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0784  hypothetical protein  29.08 
 
 
252 aa  122  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1127  hypothetical protein  27.69 
 
 
252 aa  113  3e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0581  hypothetical protein  27.5 
 
 
256 aa  112  6e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4206  hypothetical protein  27.17 
 
 
267 aa  108  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0989722  normal  0.0677891 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0238  hypothetical protein  27.71 
 
 
254 aa  105  5e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1395  hypothetical protein  29.11 
 
 
252 aa  104  1e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1549  hypothetical protein  26.22 
 
 
253 aa  95.9  6e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4595  hypothetical protein  25 
 
 
269 aa  92  8e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0158  hypothetical protein  24.73 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000200687 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0542  hypothetical protein  21.2 
 
 
235 aa  63.9  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.418977  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1110  hypothetical protein  25.99 
 
 
222 aa  63.9  0.000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0800  hypothetical protein  27.68 
 
 
209 aa  56.2  0.0000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0252181  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0153  hypothetical protein  25.31 
 
 
231 aa  54.3  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00190588  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5224  hypothetical protein  22.47 
 
 
214 aa  50.1  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.486903  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1829  hypothetical protein  22.89 
 
 
241 aa  43.9  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>