44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3986 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_3986  F0F1 ATP synthase subunit I  100 
 
 		 127 aa  250  5.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4250  F0F1 ATP synthase subunit I  69.29 
 
 		 127 aa  172  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000394682  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4540  F0F1 ATP synthase subunit I  67.72 
 
 		 127 aa  164  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000830263  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4187  F0F1 ATP synthase subunit I  68.5 
 
 		 127 aa  160  4.0000000000000004e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0000826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0001  F0F1 ATP synthase subunit I  64.57 
 
 		 127 aa  160  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000174013  hitchhiker  0.0034501 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4183  F0F1 ATP synthase subunit I  59.84 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000276133  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4219  F0F1 ATP synthase subunit I  59.84 
 
 		 127 aa  149  8.999999999999999e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000301046  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4209  F0F1 ATP synthase subunit I  59.84 
 
 		 127 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000251091  normal  0.138199 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4125  F0F1 ATP synthase subunit I  50.81 
 
 		 126 aa  101  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000524554  normal  0.148775 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4228  ATP synthase I chain  50.81 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000294824  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03623  F0F1 ATP synthase subunit I  50.81 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000273392  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  50.81 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000721396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3955  F0F1 ATP synthase subunit I  50.81 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000204463  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4255  F0F1 ATP synthase subunit I  50.81 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000153619  normal  0.0333498 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4182  F0F1 ATP synthase subunit I  50.81 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000328591  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03567  hypothetical protein  50.81 
 
 		 126 aa  85.5  2e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000214026  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4153  ATP synthase F0, I subunit  58.9 
 
 		 75 aa  67.8  0.00000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000580419  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4107  ATP synthase F0, I subunit  60 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000123417  normal  0.0706174 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5175  ATP synthase F0, I subunit  60 
 
 		 72 aa  64.7  0.0000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000733243  normal  0.0223597 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4247  ATP synthase I chain  43.9 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000661597  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04090  membrane-bound ATP synthase subunit, F1-F0-type proton-ATPase  39.62 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.0000818292  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4052  ATP synthase I chain  39.47 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4905  ATP synthase I chain  35.34 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000915146  normal  0.14779 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4493  ATP synthase I chain  34.78 
 
 		 130 aa  52.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.000280508  hitchhiker  0.00000551135 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3852  ATP synthase I chain  34.48 
 
 		 127 aa  51.6  0.000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000120633  unclonable  0.00000154846 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00429  F0F1 ATP synthase subunit I  34.17 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3759  ATP synthase I chain  38.27 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000537364  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4137  ATP synthase I chain  37.04 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.00000292688  hitchhiker  0.000119081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3932  ATP synthase I chain  37.04 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000705136  hitchhiker  0.00525591 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4024  ATP synthase I chain  37.04 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00201847  normal  0.85532 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4754  ATP synthase protein I  37.04 
 
 		 127 aa  48.1  0.00004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4302  ATP synthase I chain  33.64 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.121609  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002023  ATP synthase protein I  40.45 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000000172705  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3963  ATP synthase I chain  38.27 
 
 		 151 aa  47.8  0.00005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.296292  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4373  ATP synthase I chain  37.04 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000669  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4317  ATP synthase I chain  37.04 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000703874  hitchhiker  0.0000000000823347 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4372  ATP synthase I chain  37.04 
 
 		 127 aa  47  0.00009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000845636  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4514  ATP synthase I chain  37.04 
 
 		 151 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00144664  normal  0.0252876 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3651  ATP synthase protein I  36.59 
 
 		 127 aa  45.8  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000619385  unclonable  0.00000639496 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3066  F0F1 ATP synthase subunit I  32.79 
 
 		 129 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0005  ATP synthase protein I, putative  33.65 
 
 		 123 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0559665  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5207  F0F1 ATP synthase subunit I  35.23 
 
 		 135 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5128  F0F1 ATP synthase subunit I  40.98 
 
 		 135 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.896881 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5606  ATP synthase F0, I subunit  40.98 
 
 		 135 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>