More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3068 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3068  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 
615 aa  1257    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  34.51 
 
 
2571 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  34.51 
 
 
2571 aa  293  4e-78  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  30 
 
 
2193 aa  288  2e-76  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33280  peptide synthase  33.9 
 
 
4342 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.46218 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  33.62 
 
 
4336 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  33.11 
 
 
4336 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2829  peptide synthase  33.73 
 
 
4342 aa  283  9e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0525  non-ribosomal peptide synthase  34.33 
 
 
3180 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9641  peptide synthetase  32.94 
 
 
3761 aa  274  3e-72  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  34.36 
 
 
2189 aa  273  9e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3701  non-ribosomal peptide synthase  30.9 
 
 
3962 aa  271  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3940  peptide synthase  34.52 
 
 
4332 aa  270  5.9999999999999995e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.862701 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  33.8 
 
 
5467 aa  269  1e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3562  peptide synthase  33.55 
 
 
4317 aa  268  2e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  34.31 
 
 
5149 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  34.19 
 
 
4136 aa  267  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  31.54 
 
 
2386 aa  266  8e-70  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  32.46 
 
 
4502 aa  266  1e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  34.38 
 
 
1449 aa  265  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  32.88 
 
 
2626 aa  264  4e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.37 
 
 
2385 aa  264  4e-69  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.54 
 
 
2385 aa  263  4.999999999999999e-69  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  34.83 
 
 
8211 aa  263  8e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1676  amino acid adenylation domain-containing protein  32.76 
 
 
3432 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.602072 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01401  enterobactin synthase subunit F  31.39 
 
 
1317 aa  262  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4985  amino acid adenylation domain protein  30.24 
 
 
1336 aa  262  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.247998 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4072  amino acid adenylation domain protein  32.45 
 
 
3230 aa  262  1e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.753138 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3542  amino acid adenylation domain-containing protein  32.89 
 
 
2845 aa  261  2e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18400  non-ribosomal peptide synthase/amino acid adenylation enzyme  34.51 
 
 
5750 aa  262  2e-68  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2459  amino acid adenylation  33.56 
 
 
4489 aa  262  2e-68  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.765153 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  31.21 
 
 
2385 aa  261  3e-68  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  34.16 
 
 
3224 aa  261  3e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  31.2 
 
 
5596 aa  261  4e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  31.45 
 
 
6676 aa  259  8e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2212  amino acid adenylation  32.11 
 
 
5422 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  31.85 
 
 
6889 aa  259  1e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.55 
 
 
2385 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  30.82 
 
 
2385 aa  259  1e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  33 
 
 
2666 aa  259  1e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  31.71 
 
 
4747 aa  259  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  31.55 
 
 
2385 aa  259  1e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  30.69 
 
 
2386 aa  259  1e-67  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1845  peptide synthase  32.82 
 
 
5654 aa  258  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.82 
 
 
2385 aa  258  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  31.9 
 
 
5328 aa  258  3e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4837  amino acid adenylation  31.51 
 
 
1093 aa  258  3e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0536139 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  32.55 
 
 
4882 aa  258  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  34.34 
 
 
1839 aa  257  4e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  31.2 
 
 
5213 aa  257  4e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  31.83 
 
 
3291 aa  257  4e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3675  amino acid adenylation domain protein  34.53 
 
 
2619 aa  257  4e-67  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  34.06 
 
 
6999 aa  257  5e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  31.77 
 
 
4037 aa  256  7e-67  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  30.86 
 
 
3018 aa  256  7e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0194792 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2294  syringomycin synthetase  32.38 
 
 
6006 aa  256  1.0000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  32.48 
 
 
5953 aa  255  1.0000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1861  amino acid adenylation domain-containing protein  30.81 
 
 
2883 aa  256  1.0000000000000001e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  30.87 
 
 
4383 aa  256  1.0000000000000001e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  34.13 
 
 
1769 aa  255  1.0000000000000001e-66  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2472  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.19 
 
 
2385 aa  255  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2576  amino acid adenylation  33.33 
 
 
3165 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  31.68 
 
 
3348 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  33.05 
 
 
1776 aa  255  2.0000000000000002e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25560  Non-ribosomal peptide synthase, PvdD-like protein  32.43 
 
 
2878 aa  254  2.0000000000000002e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1624  peptide synthase  33.39 
 
 
4317 aa  254  3e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6901  amino acid adenylation domain protein  31.4 
 
 
2273 aa  254  3e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25650  peptide synthase  33.33 
 
 
4318 aa  254  4.0000000000000004e-66  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  32.97 
 
 
3219 aa  254  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  32.64 
 
 
2154 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2786  amino acid adenylation domain-containing protein  33.73 
 
 
3208 aa  253  6e-66  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0705629 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3809  peptide synthase  33.45 
 
 
4317 aa  253  6e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2211  amino acid adenylation  32.36 
 
 
2136 aa  253  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1674  amino acid adenylation domain-containing protein  34.41 
 
 
5230 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4243  peptide synthase  33.06 
 
 
4317 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2402  nonribosomal peptide synthetase DhbF  30.35 
 
 
2385 aa  251  2e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.777196  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  33.04 
 
 
3221 aa  252  2e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0566356 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1646  putative peptide synthetase  32.1 
 
 
1483 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  31.88 
 
 
3404 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0618  putative peptide synthetase  32.1 
 
 
1483 aa  251  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.099304  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  33.33 
 
 
2448 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  33.76 
 
 
4991 aa  251  2e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1733  putative peptide synthetase  32.1 
 
 
1528 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1938  putative peptide synthetase  32.1 
 
 
1520 aa  252  2e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5188  amino acid adenylation domain protein  30.12 
 
 
5738 aa  251  3e-65  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0122381 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4753  amino acid adenylation domain-containing protein  33.11 
 
 
6176 aa  250  4e-65  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.86552 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1832  amino acid adenylation  32.31 
 
 
1801 aa  250  5e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  33.1 
 
 
13537 aa  250  6e-65  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  31.63 
 
 
8646 aa  249  8e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4588  amino acid adenylation domain protein  33.33 
 
 
1925 aa  249  8e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2131  hypothetical protein  29.32 
 
 
1439 aa  249  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1160  amino acid adenylation  33.27 
 
 
3231 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1640  amino acid adenylation domain-containing protein  33.27 
 
 
3231 aa  249  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4219  non-ribosomal siderophore peptide synthetase  31.37 
 
 
3470 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3744  amino acid adenylation domain protein  31.67 
 
 
1110 aa  249  2e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696362  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  30.26 
 
 
3432 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  33.27 
 
 
9498 aa  249  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1574  amino acid adenylation domain-containing protein  31.38 
 
 
1714 aa  248  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5730  peptide synthetase  32.47 
 
 
1327 aa  248  3e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1886  amino acid adenylation domain protein  32.03 
 
 
3710 aa  248  3e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>