More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_4083 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_3930  cellulose synthase catalytic subunit  47.47 
 
 
872 aa  638    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.475933  normal  0.886251 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2635  cellulose synthase catalytic subunit  51.12 
 
 
869 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1027  cellulose synthase, catalytic subunit  50 
 
 
739 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3940  cellulose synthase (UDP-forming)  72.39 
 
 
699 aa  1078    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0284472 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1585  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.31 
 
 
848 aa  643    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.161966  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3521  cellulose synthase (UDP-forming)  48.51 
 
 
855 aa  652    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0192109  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05090  Cellulose synthase subunit AB  60.27 
 
 
1455 aa  786    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0626  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.31 
 
 
846 aa  643    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0631818  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2013  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.31 
 
 
848 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.508961  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4530  cellulose synthase (UDP-forming)  52.69 
 
 
845 aa  666    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.365333 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1363  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  52.15 
 
 
845 aa  652    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.176892 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4083  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  100 
 
 
696 aa  1430    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0797  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.56 
 
 
845 aa  648    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.429971  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3197  cellulose synthase catalytic subunit  51.34 
 
 
869 aa  657    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.611786  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1921  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  54.71 
 
 
846 aa  656    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.18381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2256  glycosyl transferase family protein  48.89 
 
 
857 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.548829 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2226  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  52.31 
 
 
846 aa  643    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.467064  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0691  glycosyl transferase, group 2 family protein  52.31 
 
 
848 aa  643    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.227734  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0903  cellulose synthase (UDP-forming)  52 
 
 
845 aa  650    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.314195  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1263  cellulose synthase (UDP-forming)  51.91 
 
 
845 aa  662    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2136  cellulose synthase catalytic subunit  50.67 
 
 
869 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1297  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  51.91 
 
 
845 aa  665    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0874534  normal  0.0554868 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1385  cellulose synthase (UDP-forming)  52 
 
 
845 aa  650    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.240967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3895  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  82.59 
 
 
702 aa  1213    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3256  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  46.57 
 
 
743 aa  640    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.843653 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2140  cellulose synthase, catalytic subunit (UDP-forming)  51.97 
 
 
848 aa  632  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.659899  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2040  cellulose synthase (UDP-forming)  46.78 
 
 
734 aa  632  1e-180  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  0.186236 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03381  cellulose synthase, catalytic subunit  46.2 
 
 
872 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.634734  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0180  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  46.2 
 
 
872 aa  629  1e-179  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3842  cellulose synthase catalytic subunit  46.2 
 
 
872 aa  629  1e-179  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.870898  normal  0.567384 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4898  cellulose synthase catalytic subunit  46.35 
 
 
872 aa  629  1e-179  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0184  cellulose synthase catalytic subunit  46.2 
 
 
872 aa  629  1e-179  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4021  cellulose synthase catalytic subunit  46.2 
 
 
872 aa  629  1e-179  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03334  hypothetical protein  46.2 
 
 
872 aa  629  1e-179  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.461813  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5836  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  46.82 
 
 
734 aa  627  1e-178  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.481815 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0148  cellulose synthase catalytic subunit  46.62 
 
 
867 aa  624  1e-177  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.805146 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3827  cellulose synthase catalytic subunit  45.82 
 
 
874 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3935  cellulose synthase catalytic subunit  45.82 
 
 
874 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0933136  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3814  cellulose synthase catalytic subunit  45.82 
 
 
874 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.24815 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3891  cellulose synthase catalytic subunit  45.82 
 
 
874 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.894407  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0073  cellulose synthase catalytic subunit  47.47 
 
 
899 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3995  cellulose synthase catalytic subunit  45.82 
 
 
874 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0076  cellulose synthase catalytic subunit  47.17 
 
 
899 aa  619  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3939  cellulose synthase catalytic subunit  45.75 
 
 
872 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.556774  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0932  cellulose synthase catalytic subunit  46.23 
 
 
872 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2074  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  48.7 
 
 
851 aa  605  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4805  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.49 
 
 
804 aa  387  1e-106  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.254969  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5208  cellulose synthase (UDP-forming)  35.9 
 
 
726 aa  386  1e-106  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.823689  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1204  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  40.18 
 
 
730 aa  383  1e-105  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0107  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  37.12 
 
 
811 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.885965 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1293  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  39.14 
 
 
730 aa  373  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.541147  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5535  cellulose synthase  36.54 
 
 
729 aa  370  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0569  cellulose synthase (UDP-forming)  35.24 
 
 
758 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1367  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  38.52 
 
 
831 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.393143  normal  0.0964081 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1567  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  38.52 
 
 
834 aa  367  1e-100  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.554043  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0333  cellulose synthase  38.62 
 
 
788 aa  365  2e-99  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.963251  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1312  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  38.96 
 
 
822 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.779544  normal  0.794607 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1978  cellulose synthase (UDP-forming)  38.45 
 
 
788 aa  363  7.0000000000000005e-99  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.693808 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0275  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  36.72 
 
 
794 aa  360  4e-98  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0962  cellulose synthase (UDP-forming)  38.23 
 
 
788 aa  359  9e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.373289 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00787  cellulose synthase catalytic subunit  34 
 
 
707 aa  353  4e-96  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1171  cellulose synthase (UDP-forming)  36.38 
 
 
909 aa  352  1e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.917806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4799  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  37.43 
 
 
930 aa  347  6e-94  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.105872 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3741  cellulose synthase catalytic subunit (UDP-forming)  35.6 
 
 
810 aa  342  9e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4173  hypothetical protein  36.48 
 
 
778 aa  340  4e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.703833  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2151  cellulose synthase (UDP-forming)  33.54 
 
 
737 aa  329  9e-89  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.242321 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1778  glycosyl transferase family protein  37.09 
 
 
1129 aa  321  3e-86  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.073121 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1847  glycosyl transferase family 2  38.33 
 
 
1140 aa  317  6e-85  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2031  glycosyl transferase family protein  37.02 
 
 
1140 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1339  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.95 
 
 
718 aa  308  2.0000000000000002e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3398  Cellulose synthase (UDP-forming)  33.08 
 
 
768 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.874799  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1932  glycosyl transferase family 2  37.17 
 
 
1140 aa  304  4.0000000000000003e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273416  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6029  cellulose synthase (UDP-forming)  37.1 
 
 
712 aa  292  1e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2377  cellulose synthase (UDP-forming)  34.73 
 
 
716 aa  291  3e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.77594  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3597  glycosyltransferase  31.42 
 
 
741 aa  289  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1133  cellulose synthase (UDP-forming)  32.42 
 
 
672 aa  268  2.9999999999999995e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0362124  normal  0.973174 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1245  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.84 
 
 
672 aa  266  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.731886  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3509  cellulose synthase (UDP-forming)  32.63 
 
 
666 aa  266  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.901561  normal  0.396718 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0466  cellulose synthase (UDP-forming)  36.16 
 
 
749 aa  265  2e-69  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.500609  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1279  Cellulose synthase (UDP-forming)  31.64 
 
 
672 aa  264  4e-69  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.14202  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4645  Cellulose synthase (UDP-forming)  32.47 
 
 
664 aa  260  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.998424 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3726  cellulose synthase (UDP-forming)  34.12 
 
 
664 aa  254  5.000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0374  cellulose synthase (UDP-forming)  34.41 
 
 
661 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1398  cellulose synthase (UDP-forming)  30.55 
 
 
740 aa  249  9e-65  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00289904  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1738  glycosyl transferase family protein  34.4 
 
 
658 aa  241  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0016739  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0794  cellulose synthase (UDP-forming)  30.37 
 
 
683 aa  237  6e-61  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.298349  normal  0.0356093 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5236  cellulose synthase (UDP-forming)  31.27 
 
 
659 aa  227  6e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3169  Cellulose synthase (UDP-forming)  33.47 
 
 
773 aa  225  2e-57  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2949  glycosyl transferase family 2  33.26 
 
 
773 aa  223  6e-57  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.496141 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0996  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.08 
 
 
657 aa  223  8e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.231155  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2310  beta 1,3 glucan synthase catalytic subunit  37.08 
 
 
655 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1082  glycosyl transferase, group 2 family protein  37.08 
 
 
657 aa  223  9.999999999999999e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.299045  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1391  putative cellulose synthase  37.08 
 
 
655 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1468  putative cellulose synthase  37.08 
 
 
655 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.244894  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0143  putative cellulose synthase  37.08 
 
 
655 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0505  putative cellulose synthase  37.08 
 
 
657 aa  222  1.9999999999999999e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3605  glycosyltransferase  32.95 
 
 
658 aa  221  3e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0354405 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4219  glycosyl transferase family protein  34.72 
 
 
659 aa  220  7.999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1324  Cellulose synthase (UDP-forming)  29.63 
 
 
652 aa  212  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.531441  normal  0.84698 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4267  RND efflux system, outer membrane lipoprotein, NodT family  34.73 
 
 
1135 aa  211  3e-53  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>