55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_0211 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_0211  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  100 
 
 
270 aa  563  1.0000000000000001e-159  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4401  TauD/TfdA family dioxygenase  26.37 
 
 
296 aa  57.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.878457  normal  0.0785293 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6587  taurine dioxygenase  30.38 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.51854  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1245  taurine dioxygenase  30.38 
 
 
308 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.830783  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6191  taurine dioxygenase  30.38 
 
 
308 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0988  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.34 
 
 
284 aa  55.5  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.534798 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2755  pyoverdine biosynthesis protein  22.47 
 
 
270 aa  52  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2152  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  22.78 
 
 
301 aa  51.6  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.898117 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1800  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  22.3 
 
 
287 aa  51.2  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.0172073 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0153  taurine dioxygenase  26.42 
 
 
302 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.93116 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6251  taurine dioxygenase  27.85 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.81693  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6536  taurine dioxygenase  27.85 
 
 
308 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.788384 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2504  taurine dioxygenase  25.64 
 
 
285 aa  49.7  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0070543 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4136  taurine dioxygenase (TauD/TfdA family)  36.51 
 
 
308 aa  48.9  0.00008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.805351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2141  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  31.34 
 
 
298 aa  48.9  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1372  Taurine dioxygenase  22.18 
 
 
293 aa  48.9  0.00009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.420541  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0690  TauD/TfdA family dioxygenase  23.84 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1740  TauD/TfdA family dioxygenase  23.84 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1139  TauD/TfdA family dioxygenase  23.84 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0776  TauD/TfdA family dioxygenase  23.84 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2415  TauD/TfdA family dioxygenase  23.84 
 
 
297 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2169  taurine dioxygenase  24.56 
 
 
302 aa  47.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460845  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6050  taurine dioxygenase  38.24 
 
 
291 aa  47.8  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4317  taurine catabolism dioxygenase  24.44 
 
 
337 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1534  PvcB protein  22.01 
 
 
287 aa  47.8  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3050  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  40.43 
 
 
294 aa  47.4  0.0003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1214  TauD/TfdA family dioxygenase  23.49 
 
 
297 aa  47  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.631548  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0978  Taurine dioxygenase  37.31 
 
 
287 aa  47.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.793561  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0137  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  44.68 
 
 
298 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1633  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  28.04 
 
 
277 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.574858 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0337  taurine dioxygenase  25.17 
 
 
298 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.477312 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3703  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  35.48 
 
 
279 aa  46.2  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4316  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  43.48 
 
 
268 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.177607  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0511  Taurine dioxygenase  38.24 
 
 
299 aa  45.4  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2155  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  22.49 
 
 
301 aa  44.7  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.449969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0704  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  36 
 
 
287 aa  45.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.211449 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04663  taurine dioxygenase  35.29 
 
 
305 aa  44.3  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3131  Pyoverdine biosynthesis protein  33.85 
 
 
587 aa  44.3  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2171  TauD/TfdA family dioxygenase  34.38 
 
 
292 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0808968  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4518  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  29.11 
 
 
310 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0513  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.43 
 
 
279 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0816  TauD/TfdA family dioxygenase  34.38 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.292051  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0908  TauD/TfdA family dioxygenase  34.38 
 
 
283 aa  44.3  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0747691  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5504  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.31 
 
 
288 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.255533  normal  0.425831 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2158  putative alpha KG dependent 2,4-D dioxygenase  28.36 
 
 
299 aa  43.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.516401  normal  0.312932 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1104  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  41.86 
 
 
279 aa  43.1  0.004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6225  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.35 
 
 
305 aa  43.1  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.906813  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34422  predicted protein  29.85 
 
 
329 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.516584  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3411  gamma butyrobetaine hydroxylase protein  48.65 
 
 
398 aa  43.1  0.005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3224  Taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  39.62 
 
 
284 aa  43.1  0.005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0464  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  27.62 
 
 
278 aa  42.4  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6394  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.35 
 
 
305 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.466619  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6627  taurine catabolism dioxygenase TauD/TfdA  32.35 
 
 
305 aa  42.4  0.008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30930  taurine catabolic dioxygenase protein  27.01 
 
 
273 aa  42.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433901  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5198  dioxygenase, TauD/TfdA family  25.17 
 
 
298 aa  42  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>