67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2918 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2918  UbiA prenyltransferase  100 
 
 
318 aa  627  1e-179  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0623  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  34.57 
 
 
507 aa  75.1  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2408  UbiA prenyltransferase  31.63 
 
 
307 aa  72.8  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1161  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  33.46 
 
 
301 aa  70.1  0.00000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000169098 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1408  NAD(P)H dehydrogenase (quinone)  30.42 
 
 
507 aa  67.4  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0795  UbiA prenyltransferase  34.78 
 
 
298 aa  65.9  0.0000000009  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0401  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase, putative  29.15 
 
 
306 aa  63.2  0.000000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0380  1,4-dihydroxy-2-naphtoate prenyltransferase  29.18 
 
 
306 aa  62.8  0.000000008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0586  1,4-dihydroxy-2-naphthoateoctaprenyltransferase  32.42 
 
 
320 aa  61.2  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0271954  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0387  UbiA prenyltransferase  36.31 
 
 
257 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00875631  normal  0.894158 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2793  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  30.18 
 
 
294 aa  60.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0120842  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_344  1,4-dihydroxy-2-naphthoateoctaprenyltransferase  27.13 
 
 
306 aa  59.7  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0341  UbiA prenyltransferase  29.29 
 
 
512 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1776  1,4-dihydroxy-2-naphthoateoctaprenyltransferase  28.02 
 
 
313 aa  58.9  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4014  UbiA prenyltransferase  35.71 
 
 
306 aa  57.4  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000693045 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1492  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  28.76 
 
 
312 aa  57  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2723  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  31.22 
 
 
297 aa  55.1  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5718  1,4-dihydroxy-2-naphthoateoctaprenyltransferase  27.1 
 
 
305 aa  53.5  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1175  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  29.49 
 
 
322 aa  52.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00354448 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1100  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  29.38 
 
 
312 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.011143  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1123  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  29.38 
 
 
312 aa  52.4  0.000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00812291  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1726  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  27.65 
 
 
291 aa  52  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2781  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  30.74 
 
 
302 aa  52  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.543056  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3285  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  31.38 
 
 
293 aa  51.6  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1242  UbiA prenyltransferase  30.67 
 
 
314 aa  51.2  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.132119  normal  0.551644 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1686  1,4-dihydroxy-2-naphtoate prenyltransferase  27.19 
 
 
291 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3079  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  30.25 
 
 
293 aa  50.8  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1692  1,4-dihydroxy-2-naphtoate prenyltransferase  27.19 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1617  1,4-dihydroxy-2-naphtoate prenyltransferase  27.19 
 
 
291 aa  50.8  0.00003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0938  1,4-dihydroxy-2-naphthoateoctaprenyltransferase  30.83 
 
 
292 aa  50.8  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3248  1,4-dihydroxy-2-naphthoateoctaprenyltransferase  30 
 
 
289 aa  50.4  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.271182 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2558  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  30.84 
 
 
290 aa  50.4  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1669  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  28.57 
 
 
316 aa  50.4  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000418378  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1366  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  29.55 
 
 
321 aa  50.4  0.00004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.154271 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1464  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  28.64 
 
 
290 aa  50.1  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.33918  hitchhiker  0.000222273 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07260  1,4-dihydroxy-2-naphtoate prenyltransferase  30.28 
 
 
289 aa  50.1  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.433691  normal  0.242194 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1366  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  28.38 
 
 
303 aa  50.1  0.00006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44670  predicted protein  26.75 
 
 
317 aa  49.7  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1718  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  27.48 
 
 
302 aa  49.7  0.00007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2785  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  24.68 
 
 
320 aa  49.3  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.30586  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1904  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  27.27 
 
 
284 aa  49.3  0.00008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0103597  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1230  1,4-dihydroxy-2-naphthoateoctaprenyltransferase  28.7 
 
 
301 aa  48.5  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1538  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  26.27 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2963  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  26.27 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.56744 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2838  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  26.27 
 
 
291 aa  48.1  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0635  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  32.2 
 
 
328 aa  47.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0295917  hitchhiker  0.000364114 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2820  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  26.27 
 
 
291 aa  48.5  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3557  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  29.27 
 
 
312 aa  47.8  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.0089648  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24200  1,4-dihydroxy-2-naphtoate prenyltransferase  31.44 
 
 
298 aa  47  0.0004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3664  1,4-dihydroxy-2-naphtoate prenyltransferase  29.55 
 
 
290 aa  47  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0492  1,4-dihydroxy-2-naphthoateoctaprenyltransferase  26.46 
 
 
342 aa  46.2  0.0006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2246  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  27.23 
 
 
305 aa  46.6  0.0006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3850  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  29.2 
 
 
294 aa  45.4  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0450  1,4-dihydroxy-2-naphthoateoctaprenyltransferase  30.57 
 
 
291 aa  44.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1609  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  24.78 
 
 
307 aa  44.7  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2084  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  29.2 
 
 
300 aa  44.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0701  1,4-dihydroxy-2-naphthoateoctaprenyltransferase  29.3 
 
 
291 aa  45.1  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0643  1,4-dihydroxy-2-naphthoateoctaprenyltransferase  29.96 
 
 
290 aa  45.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.728331 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1515  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  25.94 
 
 
289 aa  43.9  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.323447  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3462  UbiA prenyltransferase  24.35 
 
 
313 aa  44.3  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3212  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  29.15 
 
 
290 aa  43.5  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.230421  hitchhiker  0.000000292198 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001750  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  26.29 
 
 
305 aa  43.5  0.005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00263798  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1910  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase, putative  27.19 
 
 
291 aa  43.5  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17910  1,4-Dihydroxy-2-naphtoate prenyltransferase  30.52 
 
 
290 aa  43.1  0.006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0726  tocopherol phytyltransferase  25.68 
 
 
314 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00119936  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4753  1,4-dihydroxy-2-naphthoate octaprenyltransferase  25.3 
 
 
301 aa  42.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3570  1,4-dihydroxy-2-naphthoateoctaprenyltransferase  28.31 
 
 
300 aa  42.7  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.236833  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>